Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxd10P28359 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxd10P28359 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxd10P28359 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxd10P28359 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxd10P28359 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxd10P28359 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxd10P28359 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxd10P28359 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxd10P28359 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxd10P28359 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxd10P28359 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxd10P28359 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxd10P28359 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxd10P28359 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxd10P28359 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxd10P28359 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxd10P28359 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxd10P28359 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxd10P28359 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxd10P28359 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxd10P28359 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxd10P28359 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxd10P28359 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxd10P28359 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxd10P28359 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxd10P28359 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxd10P28359 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxd10P28359 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxd10P28359 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxd10P28359 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxd10P28359 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxd10P28359 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxd10P28359 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxd10P28359 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxd10P28359 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxd10P28359 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxd10P28359 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxd10P28359 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxd10P28359 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxd10P28359 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxd10P28359 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxd10P28359 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxd10P28359 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxd10P28359 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxd10P28359 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxd10P28359 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxd10P28359 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxd10P28359 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxd10P28359 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxd10P28359 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxd10P28359 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxd10P28359 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxd10P28359 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxd10P28359 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxd10P28359 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxd10P28359 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxd10P28359 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxd10P28359 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxd10P28359 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxd10P28359 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxd10P28359 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxd10P28359 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxd10P28359 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxd10P28359 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxd10P28359 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxd10P28359 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxd10P28359 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxd10P28359 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxd10P28359 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxd10P28359 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxd10P28359 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxd10P28359 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxd10P28359 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxd10P28359 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxd10P28359 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxd10P28359 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxd10P28359 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxd10P28359 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxd10P28359 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxd10P28359 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxd10P28359 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxd10P28359 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxd10P28359 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxd10P28359 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxd10P28359 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxd10P28359 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxd10P28359 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Hoxd10P28359 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Hoxd10P28359 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Hoxd10P28359 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Hoxd10P28359 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Hoxd10P28359 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxd10P28359 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxd10P28359 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxd10P28359 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxd10P28359 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxd10P28359 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxd10P28359 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxd10P28359 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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