Protein–RNA interactions for Protein: P27782

Lef1, Lymphoid enhancer-binding factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lef1P27782 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lef1P27782 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lef1P27782 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lef1P27782 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lef1P27782 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lef1P27782 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lef1P27782 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lef1P27782 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lef1P27782 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lef1P27782 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lef1P27782 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lef1P27782 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lef1P27782 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lef1P27782 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lef1P27782 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lef1P27782 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Lef1P27782 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lef1P27782 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lef1P27782 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lef1P27782 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lef1P27782 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lef1P27782 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lef1P27782 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lef1P27782 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lef1P27782 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lef1P27782 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lef1P27782 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lef1P27782 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lef1P27782 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lef1P27782 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lef1P27782 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lef1P27782 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lef1P27782 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lef1P27782 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lef1P27782 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lef1P27782 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lef1P27782 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lef1P27782 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lef1P27782 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lef1P27782 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lef1P27782 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lef1P27782 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lef1P27782 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lef1P27782 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lef1P27782 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lef1P27782 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lef1P27782 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lef1P27782 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lef1P27782 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lef1P27782 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lef1P27782 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Lef1P27782 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lef1P27782 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lef1P27782 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lef1P27782 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Lef1P27782 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lef1P27782 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lef1P27782 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lef1P27782 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lef1P27782 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lef1P27782 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lef1P27782 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lef1P27782 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lef1P27782 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lef1P27782 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lef1P27782 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lef1P27782 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lef1P27782 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lef1P27782 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lef1P27782 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lef1P27782 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lef1P27782 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lef1P27782 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lef1P27782 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lef1P27782 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lef1P27782 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lef1P27782 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lef1P27782 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lef1P27782 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lef1P27782 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lef1P27782 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lef1P27782 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lef1P27782 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lef1P27782 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lef1P27782 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lef1P27782 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Lef1P27782 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lef1P27782 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lef1P27782 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lef1P27782 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lef1P27782 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lef1P27782 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lef1P27782 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lef1P27782 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Lef1P27782 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Lef1P27782 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lef1P27782 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lef1P27782 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lef1P27782 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lef1P27782 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms