Protein–RNA interactions for Protein: P27661

H2afx, Histone H2AX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 143 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afxP27661 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
H2afxP27661 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
H2afxP27661 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
H2afxP27661 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
H2afxP27661 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
H2afxP27661 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
H2afxP27661 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
H2afxP27661 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
H2afxP27661 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
H2afxP27661 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
H2afxP27661 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
H2afxP27661 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
H2afxP27661 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
H2afxP27661 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
H2afxP27661 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
H2afxP27661 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
H2afxP27661 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
H2afxP27661 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
H2afxP27661 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
H2afxP27661 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
H2afxP27661 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
H2afxP27661 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
H2afxP27661 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
H2afxP27661 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
H2afxP27661 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
H2afxP27661 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
H2afxP27661 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
H2afxP27661 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
H2afxP27661 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
H2afxP27661 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
H2afxP27661 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
H2afxP27661 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
H2afxP27661 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
H2afxP27661 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
H2afxP27661 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
H2afxP27661 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
H2afxP27661 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
H2afxP27661 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
H2afxP27661 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
H2afxP27661 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
H2afxP27661 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
H2afxP27661 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
H2afxP27661 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
H2afxP27661 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
H2afxP27661 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
H2afxP27661 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
H2afxP27661 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
H2afxP27661 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
H2afxP27661 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
H2afxP27661 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
H2afxP27661 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
H2afxP27661 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
H2afxP27661 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
H2afxP27661 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
H2afxP27661 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
H2afxP27661 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
H2afxP27661 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
H2afxP27661 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
H2afxP27661 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
H2afxP27661 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
H2afxP27661 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
H2afxP27661 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
H2afxP27661 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
H2afxP27661 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
H2afxP27661 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
H2afxP27661 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
H2afxP27661 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
H2afxP27661 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
H2afxP27661 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
H2afxP27661 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
H2afxP27661 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
H2afxP27661 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
H2afxP27661 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
H2afxP27661 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
H2afxP27661 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
H2afxP27661 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
H2afxP27661 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
H2afxP27661 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
H2afxP27661 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
H2afxP27661 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
H2afxP27661 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
H2afxP27661 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
H2afxP27661 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
H2afxP27661 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
H2afxP27661 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
H2afxP27661 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
H2afxP27661 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
H2afxP27661 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
H2afxP27661 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
H2afxP27661 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
H2afxP27661 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
H2afxP27661 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
H2afxP27661 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
H2afxP27661 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
H2afxP27661 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
H2afxP27661 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
H2afxP27661 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
H2afxP27661 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
H2afxP27661 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
H2afxP27661 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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