Protein–RNA interactions for Protein: P26231

Ctnna1, Catenin alpha-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna1P26231 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctnna1P26231 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctnna1P26231 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctnna1P26231 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctnna1P26231 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctnna1P26231 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctnna1P26231 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctnna1P26231 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctnna1P26231 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctnna1P26231 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctnna1P26231 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctnna1P26231 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctnna1P26231 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctnna1P26231 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ctnna1P26231 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ctnna1P26231 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Ctnna1P26231 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ctnna1P26231 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ctnna1P26231 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ctnna1P26231 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ctnna1P26231 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ctnna1P26231 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctnna1P26231 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctnna1P26231 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctnna1P26231 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctnna1P26231 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctnna1P26231 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctnna1P26231 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctnna1P26231 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctnna1P26231 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctnna1P26231 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctnna1P26231 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctnna1P26231 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctnna1P26231 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctnna1P26231 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctnna1P26231 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctnna1P26231 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctnna1P26231 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctnna1P26231 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctnna1P26231 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctnna1P26231 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctnna1P26231 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctnna1P26231 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctnna1P26231 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctnna1P26231 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctnna1P26231 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctnna1P26231 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctnna1P26231 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctnna1P26231 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctnna1P26231 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctnna1P26231 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctnna1P26231 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctnna1P26231 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctnna1P26231 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctnna1P26231 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctnna1P26231 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctnna1P26231 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctnna1P26231 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctnna1P26231 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctnna1P26231 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctnna1P26231 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctnna1P26231 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctnna1P26231 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctnna1P26231 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctnna1P26231 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctnna1P26231 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctnna1P26231 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctnna1P26231 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctnna1P26231 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctnna1P26231 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctnna1P26231 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctnna1P26231 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctnna1P26231 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctnna1P26231 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctnna1P26231 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctnna1P26231 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctnna1P26231 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctnna1P26231 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctnna1P26231 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctnna1P26231 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctnna1P26231 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctnna1P26231 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctnna1P26231 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctnna1P26231 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctnna1P26231 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctnna1P26231 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctnna1P26231 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctnna1P26231 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctnna1P26231 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctnna1P26231 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctnna1P26231 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctnna1P26231 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctnna1P26231 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctnna1P26231 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctnna1P26231 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctnna1P26231 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctnna1P26231 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctnna1P26231 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctnna1P26231 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctnna1P26231 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms