Protein–RNA interactions for Protein: P23591

Tsta3, GDP-L-fucose synthase, mousemouse

Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsta3P23591 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Tsta3P23591 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tsta3P23591 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tsta3P23591 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Tsta3P23591 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tsta3P23591 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tsta3P23591 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tsta3P23591 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tsta3P23591 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tsta3P23591 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tsta3P23591 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tsta3P23591 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tsta3P23591 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tsta3P23591 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tsta3P23591 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tsta3P23591 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Tsta3P23591 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tsta3P23591 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Tsta3P23591 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tsta3P23591 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tsta3P23591 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tsta3P23591 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tsta3P23591 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tsta3P23591 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tsta3P23591 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tsta3P23591 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Tsta3P23591 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tsta3P23591 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Tsta3P23591 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tsta3P23591 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tsta3P23591 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tsta3P23591 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tsta3P23591 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tsta3P23591 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tsta3P23591 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tsta3P23591 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tsta3P23591 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tsta3P23591 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tsta3P23591 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tsta3P23591 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tsta3P23591 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tsta3P23591 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tsta3P23591 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tsta3P23591 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tsta3P23591 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tsta3P23591 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tsta3P23591 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tsta3P23591 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tsta3P23591 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tsta3P23591 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tsta3P23591 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tsta3P23591 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tsta3P23591 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tsta3P23591 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tsta3P23591 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tsta3P23591 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tsta3P23591 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tsta3P23591 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tsta3P23591 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tsta3P23591 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Tsta3P23591 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tsta3P23591 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tsta3P23591 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Tsta3P23591 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Tsta3P23591 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tsta3P23591 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tsta3P23591 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tsta3P23591 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tsta3P23591 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tsta3P23591 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tsta3P23591 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tsta3P23591 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tsta3P23591 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tsta3P23591 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tsta3P23591 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tsta3P23591 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tsta3P23591 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tsta3P23591 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tsta3P23591 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tsta3P23591 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tsta3P23591 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tsta3P23591 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tsta3P23591 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tsta3P23591 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tsta3P23591 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tsta3P23591 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tsta3P23591 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tsta3P23591 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tsta3P23591 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tsta3P23591 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tsta3P23591 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Tsta3P23591 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tsta3P23591 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tsta3P23591 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tsta3P23591 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tsta3P23591 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Tsta3P23591 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tsta3P23591 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tsta3P23591 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tsta3P23591 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.4 ms