Protein–RNA interactions for Protein: P22605

Rarb, Retinoic acid receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RarbP22605 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RarbP22605 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RarbP22605 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RarbP22605 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RarbP22605 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RarbP22605 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RarbP22605 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RarbP22605 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RarbP22605 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RarbP22605 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RarbP22605 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RarbP22605 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RarbP22605 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RarbP22605 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RarbP22605 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RarbP22605 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RarbP22605 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RarbP22605 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RarbP22605 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RarbP22605 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RarbP22605 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RarbP22605 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RarbP22605 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RarbP22605 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RarbP22605 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
RarbP22605 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RarbP22605 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RarbP22605 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RarbP22605 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RarbP22605 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RarbP22605 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RarbP22605 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RarbP22605 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
RarbP22605 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
RarbP22605 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RarbP22605 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RarbP22605 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RarbP22605 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RarbP22605 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RarbP22605 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RarbP22605 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RarbP22605 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RarbP22605 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RarbP22605 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RarbP22605 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RarbP22605 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RarbP22605 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RarbP22605 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RarbP22605 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RarbP22605 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RarbP22605 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
RarbP22605 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RarbP22605 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
RarbP22605 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
RarbP22605 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RarbP22605 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
RarbP22605 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RarbP22605 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RarbP22605 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RarbP22605 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RarbP22605 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RarbP22605 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RarbP22605 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RarbP22605 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RarbP22605 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RarbP22605 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RarbP22605 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RarbP22605 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RarbP22605 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RarbP22605 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RarbP22605 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RarbP22605 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RarbP22605 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RarbP22605 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RarbP22605 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RarbP22605 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
RarbP22605 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RarbP22605 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RarbP22605 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RarbP22605 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RarbP22605 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
RarbP22605 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RarbP22605 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RarbP22605 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RarbP22605 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RarbP22605 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RarbP22605 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RarbP22605 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RarbP22605 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RarbP22605 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RarbP22605 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
RarbP22605 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RarbP22605 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
RarbP22605 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
RarbP22605 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RarbP22605 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RarbP22605 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RarbP22605 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
RarbP22605 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RarbP22605 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.4 ms