Protein–RNA interactions for Protein: P21619

Lmnb2, Lamin-B2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmnb2P21619 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lmnb2P21619 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lmnb2P21619 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Lmnb2P21619 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lmnb2P21619 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lmnb2P21619 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lmnb2P21619 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lmnb2P21619 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lmnb2P21619 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lmnb2P21619 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lmnb2P21619 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lmnb2P21619 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lmnb2P21619 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lmnb2P21619 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lmnb2P21619 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lmnb2P21619 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lmnb2P21619 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lmnb2P21619 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lmnb2P21619 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lmnb2P21619 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lmnb2P21619 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lmnb2P21619 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lmnb2P21619 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Lmnb2P21619 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lmnb2P21619 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Lmnb2P21619 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lmnb2P21619 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lmnb2P21619 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lmnb2P21619 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lmnb2P21619 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lmnb2P21619 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lmnb2P21619 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lmnb2P21619 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lmnb2P21619 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lmnb2P21619 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lmnb2P21619 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lmnb2P21619 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Lmnb2P21619 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lmnb2P21619 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lmnb2P21619 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lmnb2P21619 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lmnb2P21619 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lmnb2P21619 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lmnb2P21619 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lmnb2P21619 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lmnb2P21619 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lmnb2P21619 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lmnb2P21619 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lmnb2P21619 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lmnb2P21619 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lmnb2P21619 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lmnb2P21619 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Lmnb2P21619 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lmnb2P21619 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lmnb2P21619 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lmnb2P21619 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lmnb2P21619 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lmnb2P21619 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lmnb2P21619 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lmnb2P21619 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lmnb2P21619 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lmnb2P21619 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lmnb2P21619 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lmnb2P21619 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lmnb2P21619 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lmnb2P21619 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Lmnb2P21619 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lmnb2P21619 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Lmnb2P21619 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lmnb2P21619 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lmnb2P21619 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lmnb2P21619 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lmnb2P21619 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lmnb2P21619 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lmnb2P21619 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lmnb2P21619 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lmnb2P21619 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lmnb2P21619 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Lmnb2P21619 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Lmnb2P21619 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lmnb2P21619 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lmnb2P21619 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lmnb2P21619 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lmnb2P21619 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lmnb2P21619 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lmnb2P21619 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lmnb2P21619 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lmnb2P21619 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lmnb2P21619 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lmnb2P21619 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lmnb2P21619 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lmnb2P21619 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lmnb2P21619 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lmnb2P21619 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Lmnb2P21619 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lmnb2P21619 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lmnb2P21619 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lmnb2P21619 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lmnb2P21619 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lmnb2P21619 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms