Protein–RNA interactions for Protein: P20152

Vim, Vimentin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VimP20152 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
VimP20152 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
VimP20152 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
VimP20152 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
VimP20152 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
VimP20152 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
VimP20152 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
VimP20152 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
VimP20152 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
VimP20152 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
VimP20152 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
VimP20152 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
VimP20152 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
VimP20152 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
VimP20152 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
VimP20152 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
VimP20152 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
VimP20152 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
VimP20152 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
VimP20152 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
VimP20152 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
VimP20152 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
VimP20152 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
VimP20152 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
VimP20152 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
VimP20152 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
VimP20152 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
VimP20152 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
VimP20152 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
VimP20152 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
VimP20152 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
VimP20152 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
VimP20152 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
VimP20152 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
VimP20152 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
VimP20152 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
VimP20152 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
VimP20152 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
VimP20152 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
VimP20152 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
VimP20152 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
VimP20152 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
VimP20152 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
VimP20152 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
VimP20152 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
VimP20152 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
VimP20152 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
VimP20152 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
VimP20152 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
VimP20152 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
VimP20152 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
VimP20152 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
VimP20152 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
VimP20152 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
VimP20152 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
VimP20152 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
VimP20152 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
VimP20152 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
VimP20152 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
VimP20152 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
VimP20152 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
VimP20152 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
VimP20152 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
VimP20152 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
VimP20152 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
VimP20152 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
VimP20152 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
VimP20152 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
VimP20152 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
VimP20152 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
VimP20152 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
VimP20152 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
VimP20152 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
VimP20152 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
VimP20152 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
VimP20152 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
VimP20152 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
VimP20152 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
VimP20152 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
VimP20152 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
VimP20152 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
VimP20152 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
VimP20152 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
VimP20152 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
VimP20152 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
VimP20152 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
VimP20152 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
VimP20152 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
VimP20152 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
VimP20152 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
VimP20152 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
VimP20152 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
VimP20152 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
VimP20152 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
VimP20152 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
VimP20152 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
VimP20152 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
VimP20152 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
VimP20152 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
VimP20152 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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