Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
P20040 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
P20040 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
P20040 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
P20040 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
P20040 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
P20040 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
P20040 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
P20040 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
P20040 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
P20040 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
P20040 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
P20040 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
P20040 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
P20040 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
P20040 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
P20040 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
P20040 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
P20040 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
P20040 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
P20040 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
P20040 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
P20040 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
P20040 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
P20040 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
P20040 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
P20040 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
P20040 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
P20040 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
P20040 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
P20040 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
P20040 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
P20040 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
P20040 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
P20040 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
P20040 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
P20040 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
P20040 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
P20040 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
P20040 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
P20040 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
P20040 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
P20040 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
P20040 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
P20040 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
P20040 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
P20040 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
P20040 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
P20040 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
P20040 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
P20040 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
P20040 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
P20040 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
P20040 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
P20040 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
P20040 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
P20040 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
P20040 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
P20040 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
P20040 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
P20040 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
P20040 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
P20040 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
P20040 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
P20040 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
P20040 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
P20040 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
P20040 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
P20040 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
P20040 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
P20040 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
P20040 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
P20040 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
P20040 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
P20040 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
P20040 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
P20040 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
P20040 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
P20040 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
P20040 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
P20040 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
P20040 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
P20040 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
P20040 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
P20040 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
P20040 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
P20040 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
P20040 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
P20040 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
P20040 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
P20040 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
P20040 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
P20040 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
P20040 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
P20040 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
P20040 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
P20040 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
P20040 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
P20040 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
P20040 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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