Protein–RNA interactions for Protein: P18653

Rps6ka1, Ribosomal protein S6 kinase alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka1P18653 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rps6ka1P18653 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rps6ka1P18653 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rps6ka1P18653 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rps6ka1P18653 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rps6ka1P18653 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rps6ka1P18653 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rps6ka1P18653 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rps6ka1P18653 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rps6ka1P18653 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rps6ka1P18653 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rps6ka1P18653 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rps6ka1P18653 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rps6ka1P18653 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rps6ka1P18653 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rps6ka1P18653 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rps6ka1P18653 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rps6ka1P18653 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rps6ka1P18653 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rps6ka1P18653 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rps6ka1P18653 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rps6ka1P18653 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rps6ka1P18653 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rps6ka1P18653 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rps6ka1P18653 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rps6ka1P18653 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps6ka1P18653 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps6ka1P18653 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps6ka1P18653 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps6ka1P18653 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps6ka1P18653 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps6ka1P18653 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps6ka1P18653 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps6ka1P18653 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps6ka1P18653 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps6ka1P18653 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps6ka1P18653 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps6ka1P18653 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps6ka1P18653 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps6ka1P18653 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps6ka1P18653 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps6ka1P18653 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps6ka1P18653 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps6ka1P18653 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps6ka1P18653 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps6ka1P18653 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps6ka1P18653 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps6ka1P18653 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps6ka1P18653 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps6ka1P18653 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps6ka1P18653 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps6ka1P18653 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps6ka1P18653 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps6ka1P18653 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps6ka1P18653 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps6ka1P18653 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps6ka1P18653 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps6ka1P18653 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps6ka1P18653 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps6ka1P18653 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps6ka1P18653 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps6ka1P18653 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps6ka1P18653 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps6ka1P18653 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps6ka1P18653 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps6ka1P18653 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps6ka1P18653 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps6ka1P18653 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps6ka1P18653 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps6ka1P18653 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps6ka1P18653 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps6ka1P18653 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps6ka1P18653 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps6ka1P18653 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps6ka1P18653 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps6ka1P18653 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps6ka1P18653 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps6ka1P18653 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps6ka1P18653 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps6ka1P18653 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps6ka1P18653 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps6ka1P18653 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps6ka1P18653 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps6ka1P18653 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps6ka1P18653 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps6ka1P18653 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps6ka1P18653 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps6ka1P18653 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rps6ka1P18653 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rps6ka1P18653 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rps6ka1P18653 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rps6ka1P18653 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rps6ka1P18653 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rps6ka1P18653 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rps6ka1P18653 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rps6ka1P18653 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rps6ka1P18653 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rps6ka1P18653 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rps6ka1P18653 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rps6ka1P18653 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms