Protein–RNA interactions for Protein: P18533

Ig heavy chain V region 733, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18533 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
P18533 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
P18533 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
P18533 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
P18533 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
P18533 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
P18533 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
P18533 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
P18533 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
P18533 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
P18533 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P18533 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P18533 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P18533 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P18533 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P18533 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P18533 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P18533 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P18533 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P18533 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P18533 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P18533 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P18533 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P18533 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
P18533 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
P18533 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
P18533 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P18533 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P18533 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P18533 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P18533 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P18533 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
P18533 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P18533 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
P18533 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P18533 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P18533 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P18533 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P18533 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P18533 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P18533 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P18533 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P18533 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P18533 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P18533 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P18533 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P18533 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P18533 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
P18533 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P18533 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
P18533 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P18533 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P18533 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
P18533 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P18533 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
P18533 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P18533 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P18533 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P18533 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
P18533 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
P18533 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P18533 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P18533 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P18533 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P18533 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P18533 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P18533 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P18533 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
P18533 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
P18533 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
P18533 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P18533 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
P18533 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P18533 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P18533 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
P18533 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P18533 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P18533 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
P18533 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P18533 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P18533 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P18533 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P18533 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P18533 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P18533 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
P18533 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P18533 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P18533 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
P18533 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P18533 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P18533 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P18533 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P18533 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
P18533 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
P18533 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P18533 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
P18533 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
P18533 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P18533 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P18533 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms