Protein–RNA interactions for Protein: P18530

Ig heavy chain V region 7-39, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18530 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.55
P18530 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
P18530 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
P18530 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
P18530 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
P18530 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
P18530 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18530 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18530 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18530 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18530 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18530 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18530 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18530 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18530 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18530 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18530 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18530 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18530 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18530 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
P18530 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18530 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18530 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
P18530 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
P18530 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18530 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
P18530 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
P18530 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18530 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18530 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18530 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18530 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18530 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18530 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18530 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18530 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18530 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18530 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18530 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18530 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18530 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18530 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18530 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18530 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18530 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18530 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18530 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18530 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18530 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18530 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18530 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18530 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18530 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18530 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18530 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18530 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18530 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18530 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18530 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18530 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18530 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18530 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18530 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P18530 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18530 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18530 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18530 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P18530 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P18530 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18530 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P18530 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P18530 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18530 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18530 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18530 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18530 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18530 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18530 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18530 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18530 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18530 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18530 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18530 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18530 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18530 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18530 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18530 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18530 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18530 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18530 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18530 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18530 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18530 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18530 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18530 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18530 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18530 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18530 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18530 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18530 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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