Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

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Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxb1P17919 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxb1P17919 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxb1P17919 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxb1P17919 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxb1P17919 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxb1P17919 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxb1P17919 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxb1P17919 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxb1P17919 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxb1P17919 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxb1P17919 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxb1P17919 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxb1P17919 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxb1P17919 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxb1P17919 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxb1P17919 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxb1P17919 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxb1P17919 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxb1P17919 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxb1P17919 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxb1P17919 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxb1P17919 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxb1P17919 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxb1P17919 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxb1P17919 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxb1P17919 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxb1P17919 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxb1P17919 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxb1P17919 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxb1P17919 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxb1P17919 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxb1P17919 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxb1P17919 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxb1P17919 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxb1P17919 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxb1P17919 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxb1P17919 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxb1P17919 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Hoxb1P17919 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Hoxb1P17919 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC12.58□□□□□ -0.39
Hoxb1P17919 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxb1P17919 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxb1P17919 Gm38116-201ENSMUST00000193873 1533 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxb1P17919 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxb1P17919 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxb1P17919 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxb1P17919 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxb1P17919 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxb1P17919 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxb1P17919 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxb1P17919 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxb1P17919 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxb1P17919 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxb1P17919 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxb1P17919 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
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Hoxb1P17919 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxb1P17919 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxb1P17919 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxb1P17919 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxb1P17919 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxb1P17919 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxb1P17919 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxb1P17919 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxb1P17919 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxb1P17919 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxb1P17919 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxb1P17919 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxb1P17919 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hoxb1P17919 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hoxb1P17919 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hoxb1P17919 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hoxb1P17919 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hoxb1P17919 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hoxb1P17919 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hoxb1P17919 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hoxb1P17919 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hoxb1P17919 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hoxb1P17919 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hoxb1P17919 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Hoxb1P17919 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hoxb1P17919 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hoxb1P17919 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hoxb1P17919 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Hoxb1P17919 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Hoxb1P17919 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hoxb1P17919 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hoxb1P17919 Gm44044-201ENSMUST00000205178 1089 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Hoxb1P17919 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hoxb1P17919 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hoxb1P17919 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hoxb1P17919 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hoxb1P17919 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hoxb1P17919 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hoxb1P17919 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hoxb1P17919 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hoxb1P17919 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hoxb1P17919 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hoxb1P17919 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
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