Protein–RNA interactions for Protein: P17918

Pcna, Proliferating cell nuclear antigen, mousemouse

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcnaP17918 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PcnaP17918 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PcnaP17918 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PcnaP17918 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PcnaP17918 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PcnaP17918 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
PcnaP17918 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PcnaP17918 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PcnaP17918 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PcnaP17918 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PcnaP17918 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PcnaP17918 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PcnaP17918 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PcnaP17918 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PcnaP17918 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PcnaP17918 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PcnaP17918 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PcnaP17918 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PcnaP17918 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PcnaP17918 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PcnaP17918 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PcnaP17918 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PcnaP17918 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PcnaP17918 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PcnaP17918 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PcnaP17918 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PcnaP17918 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PcnaP17918 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PcnaP17918 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PcnaP17918 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PcnaP17918 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PcnaP17918 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PcnaP17918 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PcnaP17918 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PcnaP17918 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PcnaP17918 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PcnaP17918 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PcnaP17918 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PcnaP17918 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PcnaP17918 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PcnaP17918 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PcnaP17918 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PcnaP17918 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PcnaP17918 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PcnaP17918 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PcnaP17918 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PcnaP17918 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PcnaP17918 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PcnaP17918 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
PcnaP17918 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
PcnaP17918 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
PcnaP17918 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
PcnaP17918 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PcnaP17918 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PcnaP17918 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PcnaP17918 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PcnaP17918 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PcnaP17918 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PcnaP17918 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PcnaP17918 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PcnaP17918 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PcnaP17918 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PcnaP17918 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PcnaP17918 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PcnaP17918 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PcnaP17918 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PcnaP17918 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PcnaP17918 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PcnaP17918 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PcnaP17918 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PcnaP17918 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PcnaP17918 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PcnaP17918 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PcnaP17918 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PcnaP17918 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PcnaP17918 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PcnaP17918 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PcnaP17918 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PcnaP17918 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PcnaP17918 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PcnaP17918 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PcnaP17918 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PcnaP17918 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PcnaP17918 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PcnaP17918 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PcnaP17918 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PcnaP17918 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PcnaP17918 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PcnaP17918 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PcnaP17918 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PcnaP17918 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PcnaP17918 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PcnaP17918 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PcnaP17918 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PcnaP17918 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PcnaP17918 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PcnaP17918 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PcnaP17918 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PcnaP17918 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PcnaP17918 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
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