Protein–RNA interactions for Protein: P16460

Ass1, Argininosuccinate synthase, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ass1P16460 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ass1P16460 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ass1P16460 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ass1P16460 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ass1P16460 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ass1P16460 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ass1P16460 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ass1P16460 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ass1P16460 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ass1P16460 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ass1P16460 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ass1P16460 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ass1P16460 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ass1P16460 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ass1P16460 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ass1P16460 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ass1P16460 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ass1P16460 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ass1P16460 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ass1P16460 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ass1P16460 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ass1P16460 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ass1P16460 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ass1P16460 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ass1P16460 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ass1P16460 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ass1P16460 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ass1P16460 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ass1P16460 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ass1P16460 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ass1P16460 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ass1P16460 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ass1P16460 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ass1P16460 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ass1P16460 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ass1P16460 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ass1P16460 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ass1P16460 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ass1P16460 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ass1P16460 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ass1P16460 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ass1P16460 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ass1P16460 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ass1P16460 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ass1P16460 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ass1P16460 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ass1P16460 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ass1P16460 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ass1P16460 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ass1P16460 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ass1P16460 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ass1P16460 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ass1P16460 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ass1P16460 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ass1P16460 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ass1P16460 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ass1P16460 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ass1P16460 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ass1P16460 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ass1P16460 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ass1P16460 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ass1P16460 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ass1P16460 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ass1P16460 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ass1P16460 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ass1P16460 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ass1P16460 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ass1P16460 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ass1P16460 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ass1P16460 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ass1P16460 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ass1P16460 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ass1P16460 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ass1P16460 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ass1P16460 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ass1P16460 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ass1P16460 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ass1P16460 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ass1P16460 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ass1P16460 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ass1P16460 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ass1P16460 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ass1P16460 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ass1P16460 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ass1P16460 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ass1P16460 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ass1P16460 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ass1P16460 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ass1P16460 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ass1P16460 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ass1P16460 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ass1P16460 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ass1P16460 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ass1P16460 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ass1P16460 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ass1P16460 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ass1P16460 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ass1P16460 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ass1P16460 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ass1P16460 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96 ms