Protein–RNA interactions for Protein: P15314

Irf1, Interferon regulatory factor 1, mousemouse

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Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf1P15314 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Irf1P15314 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Gm12106-201ENSMUST00000116006 1200 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Irf1P15314 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Irf1P15314 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Irf1P15314 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
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Irf1P15314 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
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Irf1P15314 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Irf1P15314 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Irf1P15314 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
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