Protein–RNA interactions for Protein: P12658

Calb1, Calbindin, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb1P12658 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Calb1P12658 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Calb1P12658 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Calb1P12658 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Calb1P12658 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Calb1P12658 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Calb1P12658 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Calb1P12658 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Calb1P12658 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Calb1P12658 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Calb1P12658 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Calb1P12658 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Calb1P12658 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Calb1P12658 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Calb1P12658 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Calb1P12658 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Calb1P12658 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Calb1P12658 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Calb1P12658 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Calb1P12658 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Calb1P12658 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Calb1P12658 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Calb1P12658 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Calb1P12658 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Calb1P12658 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Calb1P12658 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Calb1P12658 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Calb1P12658 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Calb1P12658 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Calb1P12658 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Calb1P12658 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Calb1P12658 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Calb1P12658 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Calb1P12658 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Calb1P12658 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Calb1P12658 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Calb1P12658 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Calb1P12658 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Calb1P12658 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Calb1P12658 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Calb1P12658 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Calb1P12658 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Calb1P12658 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Calb1P12658 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Calb1P12658 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Calb1P12658 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Calb1P12658 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Calb1P12658 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Calb1P12658 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Calb1P12658 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Calb1P12658 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Calb1P12658 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Calb1P12658 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Calb1P12658 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Calb1P12658 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Calb1P12658 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Calb1P12658 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Calb1P12658 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Calb1P12658 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Calb1P12658 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Calb1P12658 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Calb1P12658 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Calb1P12658 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Calb1P12658 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Calb1P12658 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Calb1P12658 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Calb1P12658 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Calb1P12658 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Calb1P12658 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Calb1P12658 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Calb1P12658 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Calb1P12658 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Calb1P12658 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Calb1P12658 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Calb1P12658 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Calb1P12658 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Calb1P12658 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Calb1P12658 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Calb1P12658 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Calb1P12658 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Calb1P12658 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Calb1P12658 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Calb1P12658 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Calb1P12658 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Calb1P12658 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Calb1P12658 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Calb1P12658 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Calb1P12658 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Calb1P12658 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Calb1P12658 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Calb1P12658 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Calb1P12658 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Calb1P12658 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Calb1P12658 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Calb1P12658 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Calb1P12658 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Calb1P12658 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Calb1P12658 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Calb1P12658 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Calb1P12658 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms