Protein–RNA interactions for Protein: P12657

Chrm1, Muscarinic acetylcholine receptor M1, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrm1P12657 Dcpp3-201ENSMUST00000115428 610 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chrm1P12657 Gm16044-201ENSMUST00000118475 450 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Chrm1P12657 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chrm1P12657 Gm15937-201ENSMUST00000120727 1235 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Chrm1P12657 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chrm1P12657 Gm12088-201ENSMUST00000137364 520 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chrm1P12657 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chrm1P12657 D6Ertd474e-203ENSMUST00000160188 683 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chrm1P12657 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chrm1P12657 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Chrm1P12657 Gm42696-201ENSMUST00000199859 1142 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Chrm1P12657 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chrm1P12657 AC132384.6-201ENSMUST00000218976 1206 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Chrm1P12657 AC156572.1-201ENSMUST00000221040 1161 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chrm1P12657 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chrm1P12657 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Chrm1P12657 Hesx1-202ENSMUST00000224331 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chrm1P12657 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chrm1P12657 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chrm1P12657 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chrm1P12657 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chrm1P12657 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chrm1P12657 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chrm1P12657 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Chrm1P12657 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chrm1P12657 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chrm1P12657 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Chrm1P12657 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Chrm1P12657 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chrm1P12657 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chrm1P12657 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chrm1P12657 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chrm1P12657 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chrm1P12657 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chrm1P12657 Skint10-201ENSMUST00000060327 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chrm1P12657 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chrm1P12657 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Chrm1P12657 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Chrm1P12657 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chrm1P12657 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chrm1P12657 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chrm1P12657 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chrm1P12657 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chrm1P12657 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chrm1P12657 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chrm1P12657 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chrm1P12657 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chrm1P12657 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chrm1P12657 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chrm1P12657 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chrm1P12657 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chrm1P12657 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chrm1P12657 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chrm1P12657 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chrm1P12657 Mir1192-201ENSMUST00000116976 121 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Chrm1P12657 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Chrm1P12657 Gm16285-201ENSMUST00000162999 347 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Chrm1P12657 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chrm1P12657 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Chrm1P12657 Gm20659-201ENSMUST00000176599 604 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chrm1P12657 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chrm1P12657 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chrm1P12657 Gm42464-201ENSMUST00000196717 417 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Chrm1P12657 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Chrm1P12657 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Chrm1P12657 Gm45074-201ENSMUST00000209091 1240 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Chrm1P12657 9430031K09Rik-201ENSMUST00000222913 925 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Chrm1P12657 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Chrm1P12657 AC129017.2-201ENSMUST00000226118 1284 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Chrm1P12657 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chrm1P12657 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chrm1P12657 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chrm1P12657 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chrm1P12657 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chrm1P12657 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Chrm1P12657 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chrm1P12657 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chrm1P12657 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chrm1P12657 Pla2g5-201ENSMUST00000030524 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chrm1P12657 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chrm1P12657 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chrm1P12657 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chrm1P12657 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chrm1P12657 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chrm1P12657 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chrm1P12657 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chrm1P12657 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chrm1P12657 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chrm1P12657 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chrm1P12657 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chrm1P12657 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Chrm1P12657 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Chrm1P12657 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Chrm1P12657 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chrm1P12657 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chrm1P12657 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chrm1P12657 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chrm1P12657 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chrm1P12657 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chrm1P12657 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms