Protein–RNA interactions for Protein: P11983

Tcp1, T-complex protein 1 subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcp1P11983 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tcp1P11983 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tcp1P11983 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tcp1P11983 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tcp1P11983 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tcp1P11983 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tcp1P11983 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tcp1P11983 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tcp1P11983 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tcp1P11983 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tcp1P11983 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tcp1P11983 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tcp1P11983 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tcp1P11983 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tcp1P11983 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tcp1P11983 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tcp1P11983 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tcp1P11983 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tcp1P11983 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tcp1P11983 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tcp1P11983 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tcp1P11983 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tcp1P11983 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tcp1P11983 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tcp1P11983 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tcp1P11983 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tcp1P11983 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tcp1P11983 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tcp1P11983 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tcp1P11983 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tcp1P11983 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tcp1P11983 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tcp1P11983 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tcp1P11983 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tcp1P11983 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tcp1P11983 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tcp1P11983 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tcp1P11983 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tcp1P11983 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tcp1P11983 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tcp1P11983 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tcp1P11983 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tcp1P11983 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tcp1P11983 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tcp1P11983 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tcp1P11983 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tcp1P11983 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tcp1P11983 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tcp1P11983 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tcp1P11983 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tcp1P11983 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tcp1P11983 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tcp1P11983 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tcp1P11983 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tcp1P11983 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tcp1P11983 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tcp1P11983 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tcp1P11983 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tcp1P11983 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tcp1P11983 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tcp1P11983 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tcp1P11983 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tcp1P11983 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tcp1P11983 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tcp1P11983 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tcp1P11983 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tcp1P11983 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tcp1P11983 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tcp1P11983 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tcp1P11983 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tcp1P11983 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tcp1P11983 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tcp1P11983 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tcp1P11983 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tcp1P11983 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tcp1P11983 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tcp1P11983 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tcp1P11983 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tcp1P11983 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tcp1P11983 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tcp1P11983 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tcp1P11983 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tcp1P11983 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tcp1P11983 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tcp1P11983 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tcp1P11983 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tcp1P11983 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tcp1P11983 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tcp1P11983 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tcp1P11983 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tcp1P11983 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tcp1P11983 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tcp1P11983 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tcp1P11983 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tcp1P11983 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tcp1P11983 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tcp1P11983 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tcp1P11983 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tcp1P11983 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tcp1P11983 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms