Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
P10404 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
P10404 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
P10404 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
P10404 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
P10404 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
P10404 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
P10404 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
P10404 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
P10404 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
P10404 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
P10404 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
P10404 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
P10404 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
P10404 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
P10404 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
P10404 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
P10404 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
P10404 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
P10404 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
P10404 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
P10404 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
P10404 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
P10404 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
P10404 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
P10404 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
P10404 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
P10404 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
P10404 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
P10404 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
P10404 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
P10404 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
P10404 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
P10404 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
P10404 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
P10404 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
P10404 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
P10404 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
P10404 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
P10404 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
P10404 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
P10404 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
P10404 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
P10404 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
P10404 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
P10404 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
P10404 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
P10404 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
P10404 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
P10404 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
P10404 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
P10404 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
P10404 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
P10404 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
P10404 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
P10404 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
P10404 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
P10404 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
P10404 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
P10404 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
P10404 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
P10404 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
P10404 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
P10404 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
P10404 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
P10404 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
P10404 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
P10404 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
P10404 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
P10404 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
P10404 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
P10404 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
P10404 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
P10404 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
P10404 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
P10404 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
P10404 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
P10404 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
P10404 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
P10404 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
P10404 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
P10404 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
P10404 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
P10404 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
P10404 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
P10404 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
P10404 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
P10404 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
P10404 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
P10404 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
P10404 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
P10404 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
P10404 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
P10404 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
P10404 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
P10404 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
P10404 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
P10404 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
P10404 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
P10404 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms