Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

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Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
TtrP07309 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
TtrP07309 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
TtrP07309 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
TtrP07309 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
TtrP07309 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
TtrP07309 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
TtrP07309 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
TtrP07309 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
TtrP07309 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
TtrP07309 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
TtrP07309 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
TtrP07309 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
TtrP07309 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
TtrP07309 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
TtrP07309 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
TtrP07309 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
TtrP07309 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
TtrP07309 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
TtrP07309 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
TtrP07309 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
TtrP07309 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
TtrP07309 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
TtrP07309 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
TtrP07309 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
TtrP07309 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
TtrP07309 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
TtrP07309 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
TtrP07309 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
TtrP07309 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
TtrP07309 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
TtrP07309 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
TtrP07309 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
TtrP07309 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
TtrP07309 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
TtrP07309 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
TtrP07309 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
TtrP07309 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
TtrP07309 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
TtrP07309 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
TtrP07309 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
TtrP07309 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
TtrP07309 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
TtrP07309 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TtrP07309 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TtrP07309 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TtrP07309 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
TtrP07309 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TtrP07309 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
TtrP07309 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TtrP07309 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TtrP07309 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TtrP07309 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TtrP07309 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TtrP07309 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
TtrP07309 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
TtrP07309 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TtrP07309 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TtrP07309 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TtrP07309 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TtrP07309 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
TtrP07309 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
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TtrP07309 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TtrP07309 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
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TtrP07309 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TtrP07309 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
TtrP07309 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
TtrP07309 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TtrP07309 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TtrP07309 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TtrP07309 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TtrP07309 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TtrP07309 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TtrP07309 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TtrP07309 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TtrP07309 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TtrP07309 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
TtrP07309 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TtrP07309 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TtrP07309 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TtrP07309 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TtrP07309 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
TtrP07309 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TtrP07309 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TtrP07309 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TtrP07309 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TtrP07309 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TtrP07309 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TtrP07309 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TtrP07309 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TtrP07309 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TtrP07309 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TtrP07309 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
TtrP07309 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
TtrP07309 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
TtrP07309 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TtrP07309 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TtrP07309 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
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