Protein–RNA interactions for Protein: P05622

Pdgfrb, Platelet-derived growth factor receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfrbP05622 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PdgfrbP05622 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PdgfrbP05622 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PdgfrbP05622 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PdgfrbP05622 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PdgfrbP05622 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PdgfrbP05622 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PdgfrbP05622 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PdgfrbP05622 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PdgfrbP05622 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PdgfrbP05622 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PdgfrbP05622 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PdgfrbP05622 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PdgfrbP05622 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PdgfrbP05622 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PdgfrbP05622 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PdgfrbP05622 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PdgfrbP05622 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PdgfrbP05622 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PdgfrbP05622 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PdgfrbP05622 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PdgfrbP05622 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PdgfrbP05622 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PdgfrbP05622 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PdgfrbP05622 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PdgfrbP05622 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PdgfrbP05622 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PdgfrbP05622 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PdgfrbP05622 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PdgfrbP05622 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PdgfrbP05622 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PdgfrbP05622 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PdgfrbP05622 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PdgfrbP05622 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PdgfrbP05622 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PdgfrbP05622 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PdgfrbP05622 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PdgfrbP05622 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PdgfrbP05622 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PdgfrbP05622 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PdgfrbP05622 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PdgfrbP05622 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PdgfrbP05622 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PdgfrbP05622 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PdgfrbP05622 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PdgfrbP05622 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PdgfrbP05622 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PdgfrbP05622 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PdgfrbP05622 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PdgfrbP05622 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PdgfrbP05622 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PdgfrbP05622 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PdgfrbP05622 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PdgfrbP05622 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PdgfrbP05622 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PdgfrbP05622 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PdgfrbP05622 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PdgfrbP05622 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PdgfrbP05622 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PdgfrbP05622 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PdgfrbP05622 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PdgfrbP05622 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PdgfrbP05622 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PdgfrbP05622 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PdgfrbP05622 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PdgfrbP05622 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PdgfrbP05622 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PdgfrbP05622 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PdgfrbP05622 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PdgfrbP05622 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PdgfrbP05622 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PdgfrbP05622 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PdgfrbP05622 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PdgfrbP05622 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PdgfrbP05622 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PdgfrbP05622 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PdgfrbP05622 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PdgfrbP05622 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PdgfrbP05622 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PdgfrbP05622 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PdgfrbP05622 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PdgfrbP05622 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PdgfrbP05622 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PdgfrbP05622 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PdgfrbP05622 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PdgfrbP05622 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PdgfrbP05622 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PdgfrbP05622 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PdgfrbP05622 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PdgfrbP05622 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PdgfrbP05622 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PdgfrbP05622 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PdgfrbP05622 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PdgfrbP05622 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PdgfrbP05622 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PdgfrbP05622 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PdgfrbP05622 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PdgfrbP05622 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PdgfrbP05622 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PdgfrbP05622 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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