Protein–RNA interactions for Protein: P04342

Crygd, Gamma-crystallin D, mousemouse

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrygdP04342 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CrygdP04342 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
CrygdP04342 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
CrygdP04342 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CrygdP04342 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
CrygdP04342 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CrygdP04342 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
CrygdP04342 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
CrygdP04342 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CrygdP04342 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
CrygdP04342 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
CrygdP04342 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CrygdP04342 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CrygdP04342 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
CrygdP04342 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CrygdP04342 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CrygdP04342 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CrygdP04342 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CrygdP04342 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CrygdP04342 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CrygdP04342 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CrygdP04342 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CrygdP04342 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CrygdP04342 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CrygdP04342 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CrygdP04342 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CrygdP04342 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CrygdP04342 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CrygdP04342 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CrygdP04342 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CrygdP04342 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CrygdP04342 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CrygdP04342 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CrygdP04342 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CrygdP04342 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CrygdP04342 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
CrygdP04342 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CrygdP04342 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CrygdP04342 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CrygdP04342 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
CrygdP04342 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CrygdP04342 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
CrygdP04342 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CrygdP04342 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
CrygdP04342 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CrygdP04342 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CrygdP04342 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CrygdP04342 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CrygdP04342 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
CrygdP04342 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CrygdP04342 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CrygdP04342 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CrygdP04342 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CrygdP04342 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CrygdP04342 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CrygdP04342 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CrygdP04342 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CrygdP04342 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CrygdP04342 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
CrygdP04342 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
CrygdP04342 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
CrygdP04342 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
CrygdP04342 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
CrygdP04342 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
CrygdP04342 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
CrygdP04342 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
CrygdP04342 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CrygdP04342 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CrygdP04342 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CrygdP04342 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
CrygdP04342 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
CrygdP04342 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CrygdP04342 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CrygdP04342 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CrygdP04342 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CrygdP04342 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CrygdP04342 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CrygdP04342 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
CrygdP04342 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
CrygdP04342 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
CrygdP04342 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CrygdP04342 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
CrygdP04342 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
CrygdP04342 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
CrygdP04342 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
CrygdP04342 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CrygdP04342 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CrygdP04342 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CrygdP04342 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CrygdP04342 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CrygdP04342 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CrygdP04342 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CrygdP04342 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CrygdP04342 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
CrygdP04342 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CrygdP04342 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
CrygdP04342 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CrygdP04342 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
CrygdP04342 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
CrygdP04342 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms