Protein–RNA interactions for Protein: P04212

T-cell receptor beta chain V region LB2, mousemouse

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Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04212 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
P04212 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
P04212 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
P04212 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
P04212 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
P04212 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
P04212 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P04212 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P04212 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P04212 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
P04212 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P04212 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P04212 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P04212 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P04212 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P04212 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
P04212 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P04212 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P04212 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
P04212 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P04212 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P04212 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P04212 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P04212 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P04212 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
P04212 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
P04212 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P04212 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
P04212 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P04212 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
P04212 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P04212 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P04212 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P04212 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
P04212 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P04212 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
P04212 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
P04212 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P04212 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
P04212 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P04212 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P04212 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
P04212 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P04212 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P04212 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
P04212 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
P04212 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P04212 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
P04212 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P04212 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
P04212 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P04212 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P04212 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P04212 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P04212 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
P04212 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P04212 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P04212 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P04212 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P04212 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P04212 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
P04212 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P04212 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P04212 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P04212 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P04212 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P04212 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P04212 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P04212 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P04212 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P04212 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P04212 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P04212 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P04212 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P04212 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P04212 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P04212 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P04212 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P04212 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P04212 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P04212 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P04212 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P04212 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P04212 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P04212 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P04212 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P04212 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
P04212 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
P04212 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P04212 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P04212 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P04212 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P04212 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P04212 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P04212 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P04212 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P04212 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P04212 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P04212 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P04212 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms