Protein–RNA interactions for Protein: P01921

H2-Ab1, H-2 class II histocompatibility antigen, A-D beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Ab1P01921 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
H2-Ab1P01921 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
H2-Ab1P01921 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
H2-Ab1P01921 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
H2-Ab1P01921 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
H2-Ab1P01921 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
H2-Ab1P01921 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
H2-Ab1P01921 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
H2-Ab1P01921 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
H2-Ab1P01921 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
H2-Ab1P01921 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
H2-Ab1P01921 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
H2-Ab1P01921 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
H2-Ab1P01921 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
H2-Ab1P01921 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
H2-Ab1P01921 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
H2-Ab1P01921 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
H2-Ab1P01921 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
H2-Ab1P01921 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
H2-Ab1P01921 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
H2-Ab1P01921 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
H2-Ab1P01921 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
H2-Ab1P01921 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
H2-Ab1P01921 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
H2-Ab1P01921 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
H2-Ab1P01921 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
H2-Ab1P01921 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
H2-Ab1P01921 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
H2-Ab1P01921 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
H2-Ab1P01921 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
H2-Ab1P01921 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
H2-Ab1P01921 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
H2-Ab1P01921 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
H2-Ab1P01921 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
H2-Ab1P01921 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
H2-Ab1P01921 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
H2-Ab1P01921 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
H2-Ab1P01921 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
H2-Ab1P01921 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
H2-Ab1P01921 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
H2-Ab1P01921 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
H2-Ab1P01921 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
H2-Ab1P01921 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2-Ab1P01921 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2-Ab1P01921 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2-Ab1P01921 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2-Ab1P01921 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2-Ab1P01921 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2-Ab1P01921 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2-Ab1P01921 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2-Ab1P01921 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2-Ab1P01921 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2-Ab1P01921 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2-Ab1P01921 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2-Ab1P01921 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2-Ab1P01921 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2-Ab1P01921 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2-Ab1P01921 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2-Ab1P01921 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
H2-Ab1P01921 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2-Ab1P01921 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
H2-Ab1P01921 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2-Ab1P01921 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2-Ab1P01921 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2-Ab1P01921 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2-Ab1P01921 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2-Ab1P01921 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
H2-Ab1P01921 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
H2-Ab1P01921 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2-Ab1P01921 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2-Ab1P01921 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2-Ab1P01921 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2-Ab1P01921 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2-Ab1P01921 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2-Ab1P01921 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2-Ab1P01921 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2-Ab1P01921 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2-Ab1P01921 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2-Ab1P01921 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2-Ab1P01921 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2-Ab1P01921 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
H2-Ab1P01921 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
H2-Ab1P01921 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
H2-Ab1P01921 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
H2-Ab1P01921 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
H2-Ab1P01921 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
H2-Ab1P01921 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
H2-Ab1P01921 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
H2-Ab1P01921 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
H2-Ab1P01921 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
H2-Ab1P01921 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
H2-Ab1P01921 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
H2-Ab1P01921 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
H2-Ab1P01921 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
H2-Ab1P01921 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
H2-Ab1P01921 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
H2-Ab1P01921 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
H2-Ab1P01921 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
H2-Ab1P01921 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
H2-Ab1P01921 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms