Protein–RNA interactions for Protein: O89116

Vti1a, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1A, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vti1aO89116 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vti1aO89116 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vti1aO89116 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vti1aO89116 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Vti1aO89116 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Vti1aO89116 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vti1aO89116 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vti1aO89116 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vti1aO89116 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vti1aO89116 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vti1aO89116 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vti1aO89116 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vti1aO89116 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vti1aO89116 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vti1aO89116 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vti1aO89116 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Vti1aO89116 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vti1aO89116 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vti1aO89116 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vti1aO89116 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vti1aO89116 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vti1aO89116 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vti1aO89116 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vti1aO89116 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vti1aO89116 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vti1aO89116 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vti1aO89116 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vti1aO89116 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vti1aO89116 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vti1aO89116 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vti1aO89116 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Vti1aO89116 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vti1aO89116 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vti1aO89116 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vti1aO89116 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vti1aO89116 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vti1aO89116 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vti1aO89116 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vti1aO89116 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vti1aO89116 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vti1aO89116 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vti1aO89116 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vti1aO89116 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vti1aO89116 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Vti1aO89116 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vti1aO89116 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vti1aO89116 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vti1aO89116 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vti1aO89116 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vti1aO89116 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vti1aO89116 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Vti1aO89116 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vti1aO89116 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vti1aO89116 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vti1aO89116 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vti1aO89116 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vti1aO89116 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Vti1aO89116 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vti1aO89116 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vti1aO89116 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vti1aO89116 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vti1aO89116 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vti1aO89116 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vti1aO89116 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vti1aO89116 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vti1aO89116 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vti1aO89116 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vti1aO89116 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vti1aO89116 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vti1aO89116 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vti1aO89116 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vti1aO89116 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vti1aO89116 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vti1aO89116 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vti1aO89116 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vti1aO89116 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vti1aO89116 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vti1aO89116 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vti1aO89116 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vti1aO89116 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vti1aO89116 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vti1aO89116 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vti1aO89116 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vti1aO89116 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vti1aO89116 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vti1aO89116 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vti1aO89116 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vti1aO89116 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vti1aO89116 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vti1aO89116 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vti1aO89116 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vti1aO89116 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vti1aO89116 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vti1aO89116 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vti1aO89116 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vti1aO89116 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vti1aO89116 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vti1aO89116 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vti1aO89116 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vti1aO89116 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms