Protein–RNA interactions for Protein: O88704

Hcn1, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 1, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcn1O88704 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Hcn1O88704 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hcn1O88704 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hcn1O88704 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hcn1O88704 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hcn1O88704 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hcn1O88704 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hcn1O88704 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hcn1O88704 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hcn1O88704 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hcn1O88704 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hcn1O88704 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Hcn1O88704 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hcn1O88704 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hcn1O88704 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hcn1O88704 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hcn1O88704 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hcn1O88704 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Hcn1O88704 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hcn1O88704 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hcn1O88704 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hcn1O88704 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hcn1O88704 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hcn1O88704 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hcn1O88704 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hcn1O88704 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hcn1O88704 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hcn1O88704 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hcn1O88704 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hcn1O88704 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hcn1O88704 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hcn1O88704 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hcn1O88704 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hcn1O88704 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hcn1O88704 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hcn1O88704 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hcn1O88704 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Hcn1O88704 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hcn1O88704 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hcn1O88704 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hcn1O88704 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hcn1O88704 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hcn1O88704 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Hcn1O88704 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hcn1O88704 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hcn1O88704 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hcn1O88704 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hcn1O88704 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hcn1O88704 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hcn1O88704 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hcn1O88704 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hcn1O88704 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hcn1O88704 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hcn1O88704 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hcn1O88704 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Hcn1O88704 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hcn1O88704 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hcn1O88704 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hcn1O88704 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hcn1O88704 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hcn1O88704 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hcn1O88704 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hcn1O88704 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hcn1O88704 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Hcn1O88704 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hcn1O88704 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hcn1O88704 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hcn1O88704 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hcn1O88704 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hcn1O88704 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hcn1O88704 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hcn1O88704 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hcn1O88704 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hcn1O88704 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hcn1O88704 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Hcn1O88704 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hcn1O88704 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Hcn1O88704 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hcn1O88704 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hcn1O88704 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hcn1O88704 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hcn1O88704 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hcn1O88704 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Hcn1O88704 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Hcn1O88704 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hcn1O88704 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hcn1O88704 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hcn1O88704 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hcn1O88704 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hcn1O88704 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hcn1O88704 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hcn1O88704 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hcn1O88704 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hcn1O88704 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hcn1O88704 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hcn1O88704 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hcn1O88704 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hcn1O88704 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hcn1O88704 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hcn1O88704 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.9 ms