Protein–RNA interactions for Protein: O88445

Aurkc, Aurora kinase C, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AurkcO88445 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
AurkcO88445 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
AurkcO88445 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
AurkcO88445 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
AurkcO88445 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
AurkcO88445 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
AurkcO88445 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
AurkcO88445 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
AurkcO88445 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
AurkcO88445 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
AurkcO88445 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
AurkcO88445 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
AurkcO88445 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
AurkcO88445 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
AurkcO88445 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
AurkcO88445 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
AurkcO88445 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
AurkcO88445 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
AurkcO88445 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
AurkcO88445 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
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AurkcO88445 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
AurkcO88445 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
AurkcO88445 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
AurkcO88445 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
AurkcO88445 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
AurkcO88445 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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AurkcO88445 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.18
AurkcO88445 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
AurkcO88445 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
AurkcO88445 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
AurkcO88445 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
AurkcO88445 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
AurkcO88445 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.18
AurkcO88445 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
AurkcO88445 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
AurkcO88445 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
AurkcO88445 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
AurkcO88445 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
AurkcO88445 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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AurkcO88445 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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AurkcO88445 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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AurkcO88445 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
AurkcO88445 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
AurkcO88445 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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AurkcO88445 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
AurkcO88445 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
AurkcO88445 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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AurkcO88445 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
AurkcO88445 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
AurkcO88445 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
AurkcO88445 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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AurkcO88445 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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AurkcO88445 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
AurkcO88445 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
AurkcO88445 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
AurkcO88445 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
AurkcO88445 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
AurkcO88445 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
AurkcO88445 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
AurkcO88445 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
AurkcO88445 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
AurkcO88445 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
AurkcO88445 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
AurkcO88445 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
AurkcO88445 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
AurkcO88445 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
AurkcO88445 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
AurkcO88445 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
AurkcO88445 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
AurkcO88445 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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