Protein–RNA interactions for Protein: O70480

Vamp4, Vesicle-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp4O70480 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vamp4O70480 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vamp4O70480 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vamp4O70480 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vamp4O70480 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vamp4O70480 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vamp4O70480 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vamp4O70480 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vamp4O70480 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vamp4O70480 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vamp4O70480 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vamp4O70480 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vamp4O70480 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vamp4O70480 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vamp4O70480 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vamp4O70480 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vamp4O70480 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vamp4O70480 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vamp4O70480 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vamp4O70480 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vamp4O70480 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vamp4O70480 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vamp4O70480 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vamp4O70480 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vamp4O70480 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vamp4O70480 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vamp4O70480 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Vamp4O70480 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vamp4O70480 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vamp4O70480 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vamp4O70480 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vamp4O70480 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Vamp4O70480 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vamp4O70480 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vamp4O70480 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vamp4O70480 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vamp4O70480 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Vamp4O70480 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vamp4O70480 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Vamp4O70480 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Vamp4O70480 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Vamp4O70480 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Vamp4O70480 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Vamp4O70480 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Vamp4O70480 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Vamp4O70480 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Vamp4O70480 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Vamp4O70480 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Vamp4O70480 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Vamp4O70480 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Vamp4O70480 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vamp4O70480 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vamp4O70480 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vamp4O70480 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vamp4O70480 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vamp4O70480 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vamp4O70480 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vamp4O70480 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vamp4O70480 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vamp4O70480 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vamp4O70480 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vamp4O70480 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vamp4O70480 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Vamp4O70480 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Vamp4O70480 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vamp4O70480 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vamp4O70480 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Vamp4O70480 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vamp4O70480 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vamp4O70480 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vamp4O70480 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vamp4O70480 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vamp4O70480 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vamp4O70480 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vamp4O70480 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vamp4O70480 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vamp4O70480 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vamp4O70480 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vamp4O70480 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vamp4O70480 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Vamp4O70480 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Vamp4O70480 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vamp4O70480 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vamp4O70480 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vamp4O70480 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vamp4O70480 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vamp4O70480 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Vamp4O70480 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vamp4O70480 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vamp4O70480 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vamp4O70480 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vamp4O70480 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vamp4O70480 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vamp4O70480 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Vamp4O70480 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Vamp4O70480 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vamp4O70480 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Vamp4O70480 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Vamp4O70480 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Vamp4O70480 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms