Protein–RNA interactions for Protein: O54804

Chka, Choline kinase alpha, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChkaO54804 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ChkaO54804 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ChkaO54804 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ChkaO54804 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ChkaO54804 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ChkaO54804 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ChkaO54804 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ChkaO54804 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ChkaO54804 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ChkaO54804 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
ChkaO54804 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ChkaO54804 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
ChkaO54804 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
ChkaO54804 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ChkaO54804 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ChkaO54804 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ChkaO54804 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
ChkaO54804 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
ChkaO54804 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ChkaO54804 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ChkaO54804 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ChkaO54804 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ChkaO54804 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ChkaO54804 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ChkaO54804 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ChkaO54804 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ChkaO54804 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ChkaO54804 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ChkaO54804 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ChkaO54804 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ChkaO54804 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ChkaO54804 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ChkaO54804 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ChkaO54804 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ChkaO54804 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ChkaO54804 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ChkaO54804 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ChkaO54804 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ChkaO54804 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ChkaO54804 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ChkaO54804 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ChkaO54804 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ChkaO54804 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ChkaO54804 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ChkaO54804 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ChkaO54804 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ChkaO54804 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ChkaO54804 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
ChkaO54804 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
ChkaO54804 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ChkaO54804 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ChkaO54804 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ChkaO54804 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ChkaO54804 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ChkaO54804 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ChkaO54804 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ChkaO54804 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ChkaO54804 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ChkaO54804 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ChkaO54804 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ChkaO54804 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ChkaO54804 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ChkaO54804 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ChkaO54804 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ChkaO54804 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ChkaO54804 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ChkaO54804 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ChkaO54804 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ChkaO54804 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ChkaO54804 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ChkaO54804 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ChkaO54804 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ChkaO54804 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ChkaO54804 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ChkaO54804 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ChkaO54804 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ChkaO54804 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ChkaO54804 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ChkaO54804 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ChkaO54804 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ChkaO54804 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ChkaO54804 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ChkaO54804 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ChkaO54804 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ChkaO54804 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ChkaO54804 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ChkaO54804 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ChkaO54804 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ChkaO54804 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ChkaO54804 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ChkaO54804 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
ChkaO54804 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ChkaO54804 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ChkaO54804 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ChkaO54804 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ChkaO54804 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ChkaO54804 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ChkaO54804 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ChkaO54804 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ChkaO54804 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms