Protein–RNA interactions for Protein: O54785

Limk2, LIM domain kinase 2, mousemouse

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Length 638 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limk2O54785 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Limk2O54785 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Limk2O54785 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Limk2O54785 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Limk2O54785 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Limk2O54785 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Limk2O54785 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Limk2O54785 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Limk2O54785 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Limk2O54785 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Limk2O54785 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Limk2O54785 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Limk2O54785 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Limk2O54785 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Limk2O54785 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Limk2O54785 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Limk2O54785 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Limk2O54785 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Limk2O54785 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Limk2O54785 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Limk2O54785 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Limk2O54785 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Limk2O54785 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Limk2O54785 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Limk2O54785 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Limk2O54785 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Limk2O54785 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Limk2O54785 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Limk2O54785 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Limk2O54785 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Limk2O54785 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Limk2O54785 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Limk2O54785 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Limk2O54785 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Limk2O54785 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Limk2O54785 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Limk2O54785 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Limk2O54785 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Limk2O54785 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Limk2O54785 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Limk2O54785 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Limk2O54785 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Limk2O54785 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Limk2O54785 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Limk2O54785 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Limk2O54785 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Limk2O54785 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Limk2O54785 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Limk2O54785 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Limk2O54785 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Limk2O54785 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Limk2O54785 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Limk2O54785 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Limk2O54785 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Limk2O54785 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Limk2O54785 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Limk2O54785 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Limk2O54785 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Limk2O54785 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Limk2O54785 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Limk2O54785 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Limk2O54785 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Limk2O54785 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Limk2O54785 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Limk2O54785 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Limk2O54785 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Limk2O54785 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Limk2O54785 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Limk2O54785 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Limk2O54785 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Limk2O54785 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Limk2O54785 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Limk2O54785 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Limk2O54785 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Limk2O54785 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Limk2O54785 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Limk2O54785 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Limk2O54785 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Limk2O54785 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Limk2O54785 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Limk2O54785 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Limk2O54785 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Limk2O54785 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Limk2O54785 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Limk2O54785 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Limk2O54785 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Limk2O54785 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Limk2O54785 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Limk2O54785 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Limk2O54785 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Limk2O54785 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Limk2O54785 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Limk2O54785 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Limk2O54785 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Limk2O54785 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Limk2O54785 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Limk2O54785 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Limk2O54785 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Limk2O54785 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Limk2O54785 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
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