Protein–RNA interactions for Protein: O54751

Crx, Cone-rod homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxO54751 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
CrxO54751 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
CrxO54751 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
CrxO54751 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
CrxO54751 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
CrxO54751 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
CrxO54751 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
CrxO54751 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
CrxO54751 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
CrxO54751 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
CrxO54751 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
CrxO54751 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
CrxO54751 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
CrxO54751 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
CrxO54751 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
CrxO54751 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
CrxO54751 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
CrxO54751 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
CrxO54751 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
CrxO54751 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
CrxO54751 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
CrxO54751 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
CrxO54751 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
CrxO54751 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
CrxO54751 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
CrxO54751 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
CrxO54751 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
CrxO54751 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
CrxO54751 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
CrxO54751 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
CrxO54751 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
CrxO54751 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
CrxO54751 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
CrxO54751 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
CrxO54751 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
CrxO54751 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CrxO54751 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CrxO54751 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CrxO54751 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CrxO54751 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CrxO54751 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CrxO54751 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CrxO54751 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CrxO54751 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
CrxO54751 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CrxO54751 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CrxO54751 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CrxO54751 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CrxO54751 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
CrxO54751 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CrxO54751 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
CrxO54751 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
CrxO54751 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CrxO54751 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
CrxO54751 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CrxO54751 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CrxO54751 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
CrxO54751 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CrxO54751 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CrxO54751 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CrxO54751 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CrxO54751 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CrxO54751 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
CrxO54751 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CrxO54751 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CrxO54751 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CrxO54751 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CrxO54751 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CrxO54751 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CrxO54751 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CrxO54751 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CrxO54751 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CrxO54751 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CrxO54751 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CrxO54751 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CrxO54751 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CrxO54751 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
CrxO54751 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CrxO54751 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CrxO54751 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CrxO54751 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CrxO54751 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CrxO54751 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CrxO54751 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CrxO54751 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CrxO54751 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CrxO54751 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CrxO54751 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
CrxO54751 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CrxO54751 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
CrxO54751 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
CrxO54751 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
CrxO54751 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
CrxO54751 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
CrxO54751 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
CrxO54751 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
CrxO54751 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CrxO54751 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CrxO54751 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CrxO54751 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
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