Protein–RNA interactions for Protein: O35690

Phox2b, Paired mesoderm homeobox protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phox2bO35690 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Phox2bO35690 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Phox2bO35690 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Phox2bO35690 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Phox2bO35690 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Phox2bO35690 AC154517.1-201ENSMUST00000222785 629 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Phox2bO35690 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Phox2bO35690 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Phox2bO35690 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Phox2bO35690 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Phox2bO35690 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Phox2bO35690 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Phox2bO35690 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Phox2bO35690 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Phox2bO35690 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Phox2bO35690 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Phox2bO35690 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Phox2bO35690 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Phox2bO35690 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Phox2bO35690 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Phox2bO35690 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Phox2bO35690 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Phox2bO35690 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Phox2bO35690 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Phox2bO35690 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Phox2bO35690 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Phox2bO35690 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Phox2bO35690 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Phox2bO35690 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Phox2bO35690 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Phox2bO35690 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Phox2bO35690 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Phox2bO35690 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Phox2bO35690 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Phox2bO35690 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Phox2bO35690 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Phox2bO35690 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Phox2bO35690 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Phox2bO35690 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Phox2bO35690 Gm12813-201ENSMUST00000119615 902 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Phox2bO35690 Gm13780-201ENSMUST00000150482 1187 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Phox2bO35690 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Phox2bO35690 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Phox2bO35690 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Phox2bO35690 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Phox2bO35690 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Phox2bO35690 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Phox2bO35690 Letm2-206ENSMUST00000210234 837 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Phox2bO35690 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Phox2bO35690 CT009495.1-201ENSMUST00000224221 862 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Phox2bO35690 Il2-201ENSMUST00000029275 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Phox2bO35690 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Phox2bO35690 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Phox2bO35690 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Phox2bO35690 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Phox2bO35690 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Phox2bO35690 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Phox2bO35690 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Phox2bO35690 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Phox2bO35690 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Phox2bO35690 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Phox2bO35690 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Phox2bO35690 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Phox2bO35690 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Phox2bO35690 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Phox2bO35690 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Phox2bO35690 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Phox2bO35690 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Phox2bO35690 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Phox2bO35690 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Phox2bO35690 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Phox2bO35690 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Phox2bO35690 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Phox2bO35690 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Phox2bO35690 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Phox2bO35690 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Phox2bO35690 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Phox2bO35690 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Phox2bO35690 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Phox2bO35690 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Phox2bO35690 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Phox2bO35690 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Phox2bO35690 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Phox2bO35690 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Phox2bO35690 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Phox2bO35690 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Phox2bO35690 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Phox2bO35690 AC154757.2-201ENSMUST00000228885 743 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Phox2bO35690 Gm5169-201ENSMUST00000096469 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Phox2bO35690 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Phox2bO35690 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Phox2bO35690 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Phox2bO35690 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Phox2bO35690 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Phox2bO35690 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Phox2bO35690 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Phox2bO35690 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Phox2bO35690 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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