Protein–RNA interactions for Protein: O35595

Ptch2, Protein patched homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptch2O35595 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ptch2O35595 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ptch2O35595 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ptch2O35595 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ptch2O35595 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ptch2O35595 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ptch2O35595 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ptch2O35595 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ptch2O35595 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ptch2O35595 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ptch2O35595 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ptch2O35595 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ptch2O35595 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ptch2O35595 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ptch2O35595 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ptch2O35595 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ptch2O35595 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ptch2O35595 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ptch2O35595 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ptch2O35595 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ptch2O35595 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ptch2O35595 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ptch2O35595 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ptch2O35595 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ptch2O35595 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ptch2O35595 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ptch2O35595 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ptch2O35595 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ptch2O35595 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ptch2O35595 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ptch2O35595 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ptch2O35595 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ptch2O35595 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ptch2O35595 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ptch2O35595 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ptch2O35595 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ptch2O35595 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ptch2O35595 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ptch2O35595 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ptch2O35595 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ptch2O35595 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ptch2O35595 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ptch2O35595 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ptch2O35595 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ptch2O35595 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ptch2O35595 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ptch2O35595 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ptch2O35595 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ptch2O35595 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ptch2O35595 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ptch2O35595 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ptch2O35595 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ptch2O35595 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ptch2O35595 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ptch2O35595 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ptch2O35595 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ptch2O35595 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ptch2O35595 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ptch2O35595 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ptch2O35595 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ptch2O35595 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
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Ptch2O35595 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Ptch2O35595 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ptch2O35595 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ptch2O35595 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Ptch2O35595 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ptch2O35595 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ptch2O35595 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ptch2O35595 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ptch2O35595 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ptch2O35595 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ptch2O35595 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ptch2O35595 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ptch2O35595 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ptch2O35595 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ptch2O35595 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ptch2O35595 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ptch2O35595 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ptch2O35595 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ptch2O35595 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ptch2O35595 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ptch2O35595 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ptch2O35595 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ptch2O35595 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ptch2O35595 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ptch2O35595 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ptch2O35595 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ptch2O35595 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ptch2O35595 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ptch2O35595 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ptch2O35595 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ptch2O35595 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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