Protein–RNA interactions for Protein: O35452

Tnxb, Tenascin X, mousemouse

Predictions only

Length 4,006 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnxbO35452 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TnxbO35452 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Gm4862-201ENSMUST00000170405 438 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Znhit6-206ENSMUST00000199033 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Gbgt1-201ENSMUST00000028172 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Cd55b-202ENSMUST00000119432 986 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TnxbO35452 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Gm31557-202ENSMUST00000213995 722 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TnxbO35452 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TnxbO35452 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
TnxbO35452 1810021B22Rik-201ENSMUST00000150364 652 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Ighv10-1-201ENSMUST00000103492 359 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Marcksl1-ps4-201ENSMUST00000132531 291 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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TnxbO35452 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TnxbO35452 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Yipf6-202ENSMUST00000113811 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TnxbO35452 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
TnxbO35452 AC124687.5-201ENSMUST00000222734 596 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Gm17116-201ENSMUST00000169175 1013 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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