Protein–RNA interactions for Protein: O35379

Abcc1, Multidrug resistance-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,528 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc1O35379 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Abcc1O35379 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Abcc1O35379 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Abcc1O35379 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Abcc1O35379 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Abcc1O35379 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Abcc1O35379 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Abcc1O35379 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Abcc1O35379 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Abcc1O35379 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Abcc1O35379 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Abcc1O35379 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Abcc1O35379 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Abcc1O35379 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Abcc1O35379 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Abcc1O35379 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Abcc1O35379 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Abcc1O35379 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Abcc1O35379 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Abcc1O35379 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Abcc1O35379 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Abcc1O35379 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Abcc1O35379 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Abcc1O35379 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Abcc1O35379 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Abcc1O35379 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Abcc1O35379 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Abcc1O35379 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Abcc1O35379 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Abcc1O35379 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Abcc1O35379 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Abcc1O35379 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Abcc1O35379 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Abcc1O35379 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Abcc1O35379 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Abcc1O35379 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Abcc1O35379 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Abcc1O35379 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Abcc1O35379 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Abcc1O35379 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Abcc1O35379 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Abcc1O35379 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Abcc1O35379 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Abcc1O35379 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Abcc1O35379 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Abcc1O35379 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
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Abcc1O35379 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Abcc1O35379 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Abcc1O35379 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Abcc1O35379 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Abcc1O35379 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Abcc1O35379 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Abcc1O35379 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
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Abcc1O35379 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Abcc1O35379 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Abcc1O35379 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Abcc1O35379 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
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Abcc1O35379 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Abcc1O35379 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
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Abcc1O35379 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
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Abcc1O35379 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Abcc1O35379 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
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Abcc1O35379 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Abcc1O35379 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Abcc1O35379 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Abcc1O35379 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Abcc1O35379 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Abcc1O35379 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Abcc1O35379 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Abcc1O35379 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Abcc1O35379 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Abcc1O35379 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
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Abcc1O35379 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
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Abcc1O35379 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Abcc1O35379 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Abcc1O35379 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Abcc1O35379 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Abcc1O35379 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
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