Protein–RNA interactions for Protein: O35309

Nmi, N-myc-interactor, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NmiO35309 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NmiO35309 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
NmiO35309 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NmiO35309 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NmiO35309 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NmiO35309 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NmiO35309 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NmiO35309 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NmiO35309 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NmiO35309 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NmiO35309 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NmiO35309 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NmiO35309 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NmiO35309 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NmiO35309 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NmiO35309 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NmiO35309 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NmiO35309 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NmiO35309 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NmiO35309 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NmiO35309 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NmiO35309 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
NmiO35309 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NmiO35309 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NmiO35309 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NmiO35309 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NmiO35309 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NmiO35309 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NmiO35309 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NmiO35309 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NmiO35309 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NmiO35309 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NmiO35309 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NmiO35309 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
NmiO35309 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
NmiO35309 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NmiO35309 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NmiO35309 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NmiO35309 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NmiO35309 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NmiO35309 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NmiO35309 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NmiO35309 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NmiO35309 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NmiO35309 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NmiO35309 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NmiO35309 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NmiO35309 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
NmiO35309 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
NmiO35309 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NmiO35309 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NmiO35309 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NmiO35309 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NmiO35309 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NmiO35309 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NmiO35309 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NmiO35309 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NmiO35309 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NmiO35309 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NmiO35309 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NmiO35309 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NmiO35309 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NmiO35309 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NmiO35309 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NmiO35309 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NmiO35309 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NmiO35309 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NmiO35309 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
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NmiO35309 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NmiO35309 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NmiO35309 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
NmiO35309 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NmiO35309 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NmiO35309 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NmiO35309 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NmiO35309 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NmiO35309 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NmiO35309 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NmiO35309 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NmiO35309 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
NmiO35309 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NmiO35309 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NmiO35309 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NmiO35309 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NmiO35309 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
NmiO35309 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NmiO35309 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NmiO35309 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
NmiO35309 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NmiO35309 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
NmiO35309 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NmiO35309 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NmiO35309 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NmiO35309 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NmiO35309 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NmiO35309 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
NmiO35309 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
NmiO35309 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
NmiO35309 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms