Protein–RNA interactions for Protein: O35160

Pitx3, Pituitary homeobox 3, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx3O35160 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pitx3O35160 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pitx3O35160 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pitx3O35160 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pitx3O35160 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pitx3O35160 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pitx3O35160 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pitx3O35160 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pitx3O35160 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Pitx3O35160 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pitx3O35160 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pitx3O35160 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Pitx3O35160 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pitx3O35160 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pitx3O35160 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pitx3O35160 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pitx3O35160 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Pitx3O35160 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pitx3O35160 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pitx3O35160 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pitx3O35160 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pitx3O35160 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pitx3O35160 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pitx3O35160 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pitx3O35160 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pitx3O35160 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pitx3O35160 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pitx3O35160 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pitx3O35160 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Pitx3O35160 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pitx3O35160 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pitx3O35160 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pitx3O35160 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pitx3O35160 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Pitx3O35160 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pitx3O35160 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Pitx3O35160 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Pitx3O35160 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pitx3O35160 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Pitx3O35160 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Pitx3O35160 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pitx3O35160 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pitx3O35160 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pitx3O35160 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pitx3O35160 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pitx3O35160 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Pitx3O35160 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pitx3O35160 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pitx3O35160 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pitx3O35160 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pitx3O35160 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pitx3O35160 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pitx3O35160 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pitx3O35160 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pitx3O35160 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pitx3O35160 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pitx3O35160 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pitx3O35160 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pitx3O35160 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pitx3O35160 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pitx3O35160 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pitx3O35160 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pitx3O35160 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pitx3O35160 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pitx3O35160 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pitx3O35160 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pitx3O35160 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pitx3O35160 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pitx3O35160 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Pitx3O35160 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pitx3O35160 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pitx3O35160 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pitx3O35160 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pitx3O35160 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pitx3O35160 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pitx3O35160 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pitx3O35160 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Pitx3O35160 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Pitx3O35160 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pitx3O35160 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pitx3O35160 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pitx3O35160 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pitx3O35160 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pitx3O35160 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pitx3O35160 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pitx3O35160 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pitx3O35160 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pitx3O35160 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pitx3O35160 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pitx3O35160 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pitx3O35160 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pitx3O35160 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pitx3O35160 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pitx3O35160 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pitx3O35160 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pitx3O35160 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pitx3O35160 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pitx3O35160 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pitx3O35160 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pitx3O35160 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.4 ms