Protein–RNA interactions for Protein: O08583

Alyref, THO complex subunit 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 255 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AlyrefO08583 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
AlyrefO08583 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
AlyrefO08583 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
AlyrefO08583 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
AlyrefO08583 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
AlyrefO08583 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
AlyrefO08583 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
AlyrefO08583 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
AlyrefO08583 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
AlyrefO08583 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
AlyrefO08583 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
AlyrefO08583 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
AlyrefO08583 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
AlyrefO08583 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
AlyrefO08583 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
AlyrefO08583 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
AlyrefO08583 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
AlyrefO08583 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
AlyrefO08583 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
AlyrefO08583 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
AlyrefO08583 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
AlyrefO08583 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
AlyrefO08583 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
AlyrefO08583 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
AlyrefO08583 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
AlyrefO08583 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
AlyrefO08583 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
AlyrefO08583 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
AlyrefO08583 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
AlyrefO08583 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
AlyrefO08583 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
AlyrefO08583 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
AlyrefO08583 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
AlyrefO08583 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
AlyrefO08583 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
AlyrefO08583 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
AlyrefO08583 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
AlyrefO08583 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
AlyrefO08583 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
AlyrefO08583 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
AlyrefO08583 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
AlyrefO08583 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
AlyrefO08583 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
AlyrefO08583 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
AlyrefO08583 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
AlyrefO08583 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
AlyrefO08583 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
AlyrefO08583 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AlyrefO08583 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AlyrefO08583 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AlyrefO08583 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AlyrefO08583 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
AlyrefO08583 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AlyrefO08583 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
AlyrefO08583 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
AlyrefO08583 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AlyrefO08583 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AlyrefO08583 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
AlyrefO08583 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AlyrefO08583 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
AlyrefO08583 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
AlyrefO08583 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
AlyrefO08583 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AlyrefO08583 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AlyrefO08583 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AlyrefO08583 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
AlyrefO08583 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AlyrefO08583 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AlyrefO08583 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AlyrefO08583 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AlyrefO08583 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AlyrefO08583 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
AlyrefO08583 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AlyrefO08583 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
AlyrefO08583 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
AlyrefO08583 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AlyrefO08583 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
AlyrefO08583 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AlyrefO08583 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
AlyrefO08583 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
AlyrefO08583 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AlyrefO08583 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AlyrefO08583 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
AlyrefO08583 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
AlyrefO08583 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
AlyrefO08583 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
AlyrefO08583 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AlyrefO08583 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
AlyrefO08583 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AlyrefO08583 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
AlyrefO08583 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
AlyrefO08583 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
AlyrefO08583 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
AlyrefO08583 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
AlyrefO08583 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
AlyrefO08583 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
AlyrefO08583 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AlyrefO08583 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
AlyrefO08583 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AlyrefO08583 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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