Protein–RNA interactions for Protein: M0QWN7

Usp35, Ubiquitin-specific peptidase 35, mousemouse

Predictions only

Length 1,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Usp35M0QWN7 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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Usp35M0QWN7 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp35M0QWN7 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
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Usp35M0QWN7 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp35M0QWN7 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp35M0QWN7 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
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Usp35M0QWN7 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Usp35M0QWN7 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp35M0QWN7 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Usp35M0QWN7 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp35M0QWN7 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp35M0QWN7 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp35M0QWN7 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp35M0QWN7 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 126.3 ms