Protein–RNA interactions for Protein: L7N243

Gm20939, Predicted gene, 20939, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20939L7N243 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm20939L7N243 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm20939L7N243 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm20939L7N243 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm20939L7N243 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm20939L7N243 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm20939L7N243 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm20939L7N243 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm20939L7N243 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm20939L7N243 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm20939L7N243 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm20939L7N243 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm20939L7N243 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm20939L7N243 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm20939L7N243 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm20939L7N243 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm20939L7N243 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm20939L7N243 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm20939L7N243 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm20939L7N243 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm20939L7N243 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm20939L7N243 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm20939L7N243 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm20939L7N243 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm20939L7N243 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm20939L7N243 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm20939L7N243 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm20939L7N243 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm20939L7N243 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm20939L7N243 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm20939L7N243 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm20939L7N243 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm20939L7N243 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm20939L7N243 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm20939L7N243 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm20939L7N243 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm20939L7N243 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm20939L7N243 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm20939L7N243 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm20939L7N243 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm20939L7N243 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm20939L7N243 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm20939L7N243 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm20939L7N243 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm20939L7N243 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm20939L7N243 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm20939L7N243 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm20939L7N243 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm20939L7N243 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm20939L7N243 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm20939L7N243 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm20939L7N243 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm20939L7N243 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm20939L7N243 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm20939L7N243 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm20939L7N243 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm20939L7N243 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm20939L7N243 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm20939L7N243 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm20939L7N243 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm20939L7N243 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm20939L7N243 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm20939L7N243 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm20939L7N243 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm20939L7N243 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm20939L7N243 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm20939L7N243 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm20939L7N243 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm20939L7N243 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm20939L7N243 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm20939L7N243 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm20939L7N243 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm20939L7N243 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm20939L7N243 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm20939L7N243 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm20939L7N243 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm20939L7N243 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm20939L7N243 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm20939L7N243 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm20939L7N243 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm20939L7N243 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm20939L7N243 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm20939L7N243 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm20939L7N243 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm20939L7N243 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm20939L7N243 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm20939L7N243 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm20939L7N243 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm20939L7N243 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm20939L7N243 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm20939L7N243 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm20939L7N243 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm20939L7N243 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm20939L7N243 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm20939L7N243 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm20939L7N243 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm20939L7N243 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm20939L7N243 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm20939L7N243 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm20939L7N243 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
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