Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ27

Ccdc191, Coiled-coil domain-containing 191, mousemouse

Predictions only

Length 883 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc191J3QQ27 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc191J3QQ27 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc191J3QQ27 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc191J3QQ27 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc191J3QQ27 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc191J3QQ27 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc191J3QQ27 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc191J3QQ27 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc191J3QQ27 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc191J3QQ27 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc191J3QQ27 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc191J3QQ27 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc191J3QQ27 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc191J3QQ27 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc191J3QQ27 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc191J3QQ27 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc191J3QQ27 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc191J3QQ27 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc191J3QQ27 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc191J3QQ27 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc191J3QQ27 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc191J3QQ27 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc191J3QQ27 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc191J3QQ27 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc191J3QQ27 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc191J3QQ27 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc191J3QQ27 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc191J3QQ27 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc191J3QQ27 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc191J3QQ27 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc191J3QQ27 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc191J3QQ27 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc191J3QQ27 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc191J3QQ27 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc191J3QQ27 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc191J3QQ27 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc191J3QQ27 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc191J3QQ27 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc191J3QQ27 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc191J3QQ27 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc191J3QQ27 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc191J3QQ27 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc191J3QQ27 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc191J3QQ27 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc191J3QQ27 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc191J3QQ27 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc191J3QQ27 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc191J3QQ27 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc191J3QQ27 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc191J3QQ27 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc191J3QQ27 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc191J3QQ27 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc191J3QQ27 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc191J3QQ27 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc191J3QQ27 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc191J3QQ27 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc191J3QQ27 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc191J3QQ27 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc191J3QQ27 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc191J3QQ27 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc191J3QQ27 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc191J3QQ27 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc191J3QQ27 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc191J3QQ27 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc191J3QQ27 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc191J3QQ27 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc191J3QQ27 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc191J3QQ27 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc191J3QQ27 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc191J3QQ27 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc191J3QQ27 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc191J3QQ27 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc191J3QQ27 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc191J3QQ27 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc191J3QQ27 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc191J3QQ27 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc191J3QQ27 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc191J3QQ27 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc191J3QQ27 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc191J3QQ27 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc191J3QQ27 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc191J3QQ27 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc191J3QQ27 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc191J3QQ27 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc191J3QQ27 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc191J3QQ27 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc191J3QQ27 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc191J3QQ27 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc191J3QQ27 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc191J3QQ27 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc191J3QQ27 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc191J3QQ27 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc191J3QQ27 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc191J3QQ27 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc191J3QQ27 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc191J3QQ27 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc191J3QQ27 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc191J3QQ27 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc191J3QQ27 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc191J3QQ27 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms