Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ23

Gm21310, Predicted gene, 21310, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21310J3QQ23 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21310J3QQ23 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21310J3QQ23 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21310J3QQ23 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21310J3QQ23 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21310J3QQ23 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21310J3QQ23 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21310J3QQ23 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21310J3QQ23 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21310J3QQ23 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21310J3QQ23 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21310J3QQ23 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21310J3QQ23 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21310J3QQ23 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21310J3QQ23 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21310J3QQ23 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21310J3QQ23 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21310J3QQ23 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21310J3QQ23 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21310J3QQ23 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21310J3QQ23 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21310J3QQ23 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21310J3QQ23 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm21310J3QQ23 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm21310J3QQ23 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm21310J3QQ23 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm21310J3QQ23 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm21310J3QQ23 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm21310J3QQ23 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm21310J3QQ23 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm21310J3QQ23 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm21310J3QQ23 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm21310J3QQ23 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm21310J3QQ23 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm21310J3QQ23 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm21310J3QQ23 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm21310J3QQ23 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm21310J3QQ23 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm21310J3QQ23 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm21310J3QQ23 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm21310J3QQ23 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm21310J3QQ23 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm21310J3QQ23 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm21310J3QQ23 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm21310J3QQ23 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm21310J3QQ23 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm21310J3QQ23 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm21310J3QQ23 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm21310J3QQ23 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm21310J3QQ23 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm21310J3QQ23 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm21310J3QQ23 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm21310J3QQ23 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm21310J3QQ23 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm21310J3QQ23 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm21310J3QQ23 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm21310J3QQ23 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm21310J3QQ23 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm21310J3QQ23 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm21310J3QQ23 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm21310J3QQ23 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm21310J3QQ23 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm21310J3QQ23 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm21310J3QQ23 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm21310J3QQ23 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm21310J3QQ23 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm21310J3QQ23 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm21310J3QQ23 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm21310J3QQ23 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm21310J3QQ23 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm21310J3QQ23 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm21310J3QQ23 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm21310J3QQ23 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21310J3QQ23 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21310J3QQ23 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21310J3QQ23 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21310J3QQ23 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21310J3QQ23 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21310J3QQ23 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21310J3QQ23 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21310J3QQ23 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21310J3QQ23 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21310J3QQ23 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21310J3QQ23 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21310J3QQ23 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21310J3QQ23 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21310J3QQ23 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21310J3QQ23 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21310J3QQ23 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21310J3QQ23 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21310J3QQ23 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21310J3QQ23 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21310J3QQ23 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21310J3QQ23 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21310J3QQ23 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21310J3QQ23 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21310J3QQ23 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21310J3QQ23 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21310J3QQ23 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21310J3QQ23 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms