Protein–RNA interactions for Protein: J3QPX5

Gm8888, Predicted gene 8888, mousemouse

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8888J3QPX5 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm8888J3QPX5 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm8888J3QPX5 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm8888J3QPX5 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm8888J3QPX5 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm8888J3QPX5 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm8888J3QPX5 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm8888J3QPX5 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm8888J3QPX5 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm8888J3QPX5 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm8888J3QPX5 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm8888J3QPX5 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm8888J3QPX5 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm8888J3QPX5 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm8888J3QPX5 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm8888J3QPX5 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm8888J3QPX5 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm8888J3QPX5 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm8888J3QPX5 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm8888J3QPX5 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm8888J3QPX5 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm8888J3QPX5 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm8888J3QPX5 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm8888J3QPX5 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm8888J3QPX5 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm8888J3QPX5 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm8888J3QPX5 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm8888J3QPX5 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Gm8888J3QPX5 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Gm8888J3QPX5 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Gm8888J3QPX5 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Gm8888J3QPX5 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm8888J3QPX5 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Gm8888J3QPX5 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Gm8888J3QPX5 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm8888J3QPX5 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm8888J3QPX5 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm8888J3QPX5 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm8888J3QPX5 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm8888J3QPX5 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm8888J3QPX5 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Gm8888J3QPX5 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Gm8888J3QPX5 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm8888J3QPX5 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm8888J3QPX5 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm8888J3QPX5 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm8888J3QPX5 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm8888J3QPX5 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm8888J3QPX5 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm8888J3QPX5 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm8888J3QPX5 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm8888J3QPX5 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm8888J3QPX5 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm8888J3QPX5 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm8888J3QPX5 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm8888J3QPX5 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm8888J3QPX5 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm8888J3QPX5 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm8888J3QPX5 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm8888J3QPX5 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm8888J3QPX5 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm8888J3QPX5 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm8888J3QPX5 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm8888J3QPX5 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm8888J3QPX5 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm8888J3QPX5 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm8888J3QPX5 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm8888J3QPX5 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm8888J3QPX5 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms