Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS7

Gm11236, Predicted gene 11236, mousemouse

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Length 360 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm11236J3QMS7 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm11236J3QMS7 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm11236J3QMS7 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm11236J3QMS7 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm11236J3QMS7 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm11236J3QMS7 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm11236J3QMS7 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm11236J3QMS7 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm11236J3QMS7 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm11236J3QMS7 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm11236J3QMS7 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm11236J3QMS7 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm11236J3QMS7 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm11236J3QMS7 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm11236J3QMS7 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm11236J3QMS7 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm11236J3QMS7 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm11236J3QMS7 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm11236J3QMS7 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm11236J3QMS7 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm11236J3QMS7 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm11236J3QMS7 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm11236J3QMS7 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm11236J3QMS7 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm11236J3QMS7 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm11236J3QMS7 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm11236J3QMS7 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm11236J3QMS7 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm11236J3QMS7 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm11236J3QMS7 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm11236J3QMS7 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm11236J3QMS7 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm11236J3QMS7 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm11236J3QMS7 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm11236J3QMS7 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm11236J3QMS7 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm11236J3QMS7 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm11236J3QMS7 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm11236J3QMS7 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm11236J3QMS7 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm11236J3QMS7 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm11236J3QMS7 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm11236J3QMS7 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm11236J3QMS7 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm11236J3QMS7 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm11236J3QMS7 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm11236J3QMS7 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm11236J3QMS7 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm11236J3QMS7 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm11236J3QMS7 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm11236J3QMS7 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm11236J3QMS7 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm11236J3QMS7 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm11236J3QMS7 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm11236J3QMS7 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm11236J3QMS7 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm11236J3QMS7 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm11236J3QMS7 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm11236J3QMS7 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm11236J3QMS7 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm11236J3QMS7 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm11236J3QMS7 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm11236J3QMS7 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm11236J3QMS7 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm11236J3QMS7 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm11236J3QMS7 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm11236J3QMS7 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm11236J3QMS7 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm11236J3QMS7 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
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Gm11236J3QMS7 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm11236J3QMS7 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm11236J3QMS7 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm11236J3QMS7 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm11236J3QMS7 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm11236J3QMS7 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm11236J3QMS7 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm11236J3QMS7 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm11236J3QMS7 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm11236J3QMS7 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm11236J3QMS7 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm11236J3QMS7 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm11236J3QMS7 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm11236J3QMS7 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm11236J3QMS7 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm11236J3QMS7 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm11236J3QMS7 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm11236J3QMS7 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm11236J3QMS7 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm11236J3QMS7 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm11236J3QMS7 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm11236J3QMS7 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm11236J3QMS7 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm11236J3QMS7 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm11236J3QMS7 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm11236J3QMS7 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm11236J3QMS7 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm11236J3QMS7 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm11236J3QMS7 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm11236J3QMS7 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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