Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cldn34c3J3QJW5 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cldn34c3J3QJW5 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cldn34c3J3QJW5 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cldn34c3J3QJW5 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cldn34c3J3QJW5 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Cldn34c3J3QJW5 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cldn34c3J3QJW5 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cldn34c3J3QJW5 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cldn34c3J3QJW5 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cldn34c3J3QJW5 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cldn34c3J3QJW5 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cldn34c3J3QJW5 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cldn34c3J3QJW5 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cldn34c3J3QJW5 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cldn34c3J3QJW5 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cldn34c3J3QJW5 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cldn34c3J3QJW5 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cldn34c3J3QJW5 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cldn34c3J3QJW5 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn34c3J3QJW5 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn34c3J3QJW5 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn34c3J3QJW5 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn34c3J3QJW5 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn34c3J3QJW5 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn34c3J3QJW5 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn34c3J3QJW5 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn34c3J3QJW5 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn34c3J3QJW5 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn34c3J3QJW5 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn34c3J3QJW5 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn34c3J3QJW5 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn34c3J3QJW5 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn34c3J3QJW5 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn34c3J3QJW5 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn34c3J3QJW5 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn34c3J3QJW5 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn34c3J3QJW5 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn34c3J3QJW5 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn34c3J3QJW5 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn34c3J3QJW5 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn34c3J3QJW5 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn34c3J3QJW5 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn34c3J3QJW5 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn34c3J3QJW5 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn34c3J3QJW5 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn34c3J3QJW5 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn34c3J3QJW5 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn34c3J3QJW5 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn34c3J3QJW5 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn34c3J3QJW5 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn34c3J3QJW5 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn34c3J3QJW5 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn34c3J3QJW5 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn34c3J3QJW5 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn34c3J3QJW5 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn34c3J3QJW5 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn34c3J3QJW5 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn34c3J3QJW5 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn34c3J3QJW5 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn34c3J3QJW5 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn34c3J3QJW5 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn34c3J3QJW5 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn34c3J3QJW5 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn34c3J3QJW5 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn34c3J3QJW5 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn34c3J3QJW5 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn34c3J3QJW5 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn34c3J3QJW5 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn34c3J3QJW5 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn34c3J3QJW5 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn34c3J3QJW5 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn34c3J3QJW5 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn34c3J3QJW5 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn34c3J3QJW5 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn34c3J3QJW5 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn34c3J3QJW5 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn34c3J3QJW5 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn34c3J3QJW5 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn34c3J3QJW5 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn34c3J3QJW5 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn34c3J3QJW5 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn34c3J3QJW5 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn34c3J3QJW5 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn34c3J3QJW5 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn34c3J3QJW5 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn34c3J3QJW5 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn34c3J3QJW5 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn34c3J3QJW5 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn34c3J3QJW5 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn34c3J3QJW5 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn34c3J3QJW5 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn34c3J3QJW5 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn34c3J3QJW5 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn34c3J3QJW5 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn34c3J3QJW5 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn34c3J3QJW5 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn34c3J3QJW5 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn34c3J3QJW5 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn34c3J3QJW5 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
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