Protein–RNA interactions for Protein: H7BX78

Zfp408, Zinc finger protein 408, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp408H7BX78 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp408H7BX78 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp408H7BX78 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp408H7BX78 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp408H7BX78 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp408H7BX78 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp408H7BX78 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp408H7BX78 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp408H7BX78 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp408H7BX78 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp408H7BX78 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp408H7BX78 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp408H7BX78 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp408H7BX78 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp408H7BX78 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp408H7BX78 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp408H7BX78 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp408H7BX78 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp408H7BX78 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp408H7BX78 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp408H7BX78 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp408H7BX78 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp408H7BX78 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp408H7BX78 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp408H7BX78 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp408H7BX78 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp408H7BX78 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp408H7BX78 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp408H7BX78 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp408H7BX78 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp408H7BX78 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp408H7BX78 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp408H7BX78 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp408H7BX78 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp408H7BX78 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp408H7BX78 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp408H7BX78 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp408H7BX78 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp408H7BX78 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp408H7BX78 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp408H7BX78 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp408H7BX78 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp408H7BX78 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp408H7BX78 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp408H7BX78 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp408H7BX78 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp408H7BX78 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp408H7BX78 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp408H7BX78 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp408H7BX78 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp408H7BX78 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp408H7BX78 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp408H7BX78 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp408H7BX78 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp408H7BX78 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp408H7BX78 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp408H7BX78 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp408H7BX78 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp408H7BX78 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp408H7BX78 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp408H7BX78 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp408H7BX78 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp408H7BX78 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp408H7BX78 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp408H7BX78 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp408H7BX78 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp408H7BX78 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp408H7BX78 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp408H7BX78 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp408H7BX78 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp408H7BX78 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp408H7BX78 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp408H7BX78 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp408H7BX78 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp408H7BX78 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp408H7BX78 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp408H7BX78 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp408H7BX78 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp408H7BX78 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp408H7BX78 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp408H7BX78 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp408H7BX78 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp408H7BX78 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp408H7BX78 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp408H7BX78 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp408H7BX78 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp408H7BX78 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp408H7BX78 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp408H7BX78 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp408H7BX78 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp408H7BX78 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp408H7BX78 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp408H7BX78 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp408H7BX78 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp408H7BX78 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp408H7BX78 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp408H7BX78 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp408H7BX78 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp408H7BX78 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp408H7BX78 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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