Protein–RNA interactions for Protein: G5E8Z2

Taf4b, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4bG5E8Z2 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Taf4bG5E8Z2 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Taf4bG5E8Z2 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Taf4bG5E8Z2 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Taf4bG5E8Z2 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Taf4bG5E8Z2 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Taf4bG5E8Z2 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Taf4bG5E8Z2 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Taf4bG5E8Z2 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Taf4bG5E8Z2 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Taf4bG5E8Z2 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Taf4bG5E8Z2 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Taf4bG5E8Z2 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Taf4bG5E8Z2 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Taf4bG5E8Z2 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Taf4bG5E8Z2 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Taf4bG5E8Z2 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Taf4bG5E8Z2 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Taf4bG5E8Z2 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Taf4bG5E8Z2 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Taf4bG5E8Z2 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Taf4bG5E8Z2 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Taf4bG5E8Z2 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Taf4bG5E8Z2 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Taf4bG5E8Z2 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Taf4bG5E8Z2 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Taf4bG5E8Z2 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Taf4bG5E8Z2 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Taf4bG5E8Z2 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Taf4bG5E8Z2 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Taf4bG5E8Z2 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Taf4bG5E8Z2 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Taf4bG5E8Z2 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Taf4bG5E8Z2 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Taf4bG5E8Z2 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Taf4bG5E8Z2 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Taf4bG5E8Z2 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Taf4bG5E8Z2 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Taf4bG5E8Z2 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Taf4bG5E8Z2 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Taf4bG5E8Z2 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Taf4bG5E8Z2 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Taf4bG5E8Z2 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Taf4bG5E8Z2 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Taf4bG5E8Z2 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Taf4bG5E8Z2 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Taf4bG5E8Z2 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Taf4bG5E8Z2 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Taf4bG5E8Z2 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Taf4bG5E8Z2 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Taf4bG5E8Z2 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Taf4bG5E8Z2 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Taf4bG5E8Z2 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Taf4bG5E8Z2 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Taf4bG5E8Z2 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Taf4bG5E8Z2 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Taf4bG5E8Z2 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Taf4bG5E8Z2 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Taf4bG5E8Z2 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Taf4bG5E8Z2 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Taf4bG5E8Z2 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Taf4bG5E8Z2 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Taf4bG5E8Z2 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Taf4bG5E8Z2 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Taf4bG5E8Z2 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Taf4bG5E8Z2 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Taf4bG5E8Z2 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Taf4bG5E8Z2 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Taf4bG5E8Z2 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Taf4bG5E8Z2 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Taf4bG5E8Z2 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Taf4bG5E8Z2 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Taf4bG5E8Z2 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Taf4bG5E8Z2 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Taf4bG5E8Z2 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Taf4bG5E8Z2 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Taf4bG5E8Z2 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Taf4bG5E8Z2 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Taf4bG5E8Z2 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Taf4bG5E8Z2 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Taf4bG5E8Z2 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Taf4bG5E8Z2 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Taf4bG5E8Z2 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Taf4bG5E8Z2 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Taf4bG5E8Z2 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Taf4bG5E8Z2 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Taf4bG5E8Z2 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Taf4bG5E8Z2 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Taf4bG5E8Z2 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Taf4bG5E8Z2 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Taf4bG5E8Z2 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Taf4bG5E8Z2 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Taf4bG5E8Z2 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Taf4bG5E8Z2 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Taf4bG5E8Z2 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Taf4bG5E8Z2 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Taf4bG5E8Z2 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Taf4bG5E8Z2 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Taf4bG5E8Z2 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Taf4bG5E8Z2 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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