Protein–RNA interactions for Protein: G3X9R7

Rnf148, RING finger protein 148, mousemouse

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf148G3X9R7 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf148G3X9R7 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf148G3X9R7 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf148G3X9R7 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf148G3X9R7 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf148G3X9R7 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf148G3X9R7 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf148G3X9R7 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf148G3X9R7 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf148G3X9R7 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf148G3X9R7 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf148G3X9R7 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf148G3X9R7 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf148G3X9R7 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf148G3X9R7 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf148G3X9R7 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf148G3X9R7 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf148G3X9R7 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf148G3X9R7 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf148G3X9R7 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf148G3X9R7 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf148G3X9R7 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf148G3X9R7 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf148G3X9R7 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf148G3X9R7 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf148G3X9R7 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf148G3X9R7 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf148G3X9R7 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf148G3X9R7 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf148G3X9R7 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf148G3X9R7 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf148G3X9R7 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf148G3X9R7 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf148G3X9R7 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf148G3X9R7 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf148G3X9R7 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf148G3X9R7 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf148G3X9R7 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf148G3X9R7 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf148G3X9R7 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf148G3X9R7 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf148G3X9R7 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf148G3X9R7 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf148G3X9R7 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf148G3X9R7 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf148G3X9R7 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf148G3X9R7 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf148G3X9R7 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf148G3X9R7 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf148G3X9R7 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf148G3X9R7 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf148G3X9R7 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf148G3X9R7 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf148G3X9R7 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf148G3X9R7 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf148G3X9R7 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf148G3X9R7 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf148G3X9R7 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf148G3X9R7 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf148G3X9R7 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf148G3X9R7 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf148G3X9R7 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf148G3X9R7 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf148G3X9R7 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf148G3X9R7 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf148G3X9R7 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf148G3X9R7 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf148G3X9R7 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf148G3X9R7 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf148G3X9R7 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf148G3X9R7 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf148G3X9R7 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf148G3X9R7 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf148G3X9R7 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf148G3X9R7 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf148G3X9R7 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf148G3X9R7 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf148G3X9R7 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf148G3X9R7 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf148G3X9R7 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf148G3X9R7 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf148G3X9R7 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf148G3X9R7 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf148G3X9R7 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf148G3X9R7 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf148G3X9R7 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf148G3X9R7 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf148G3X9R7 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf148G3X9R7 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf148G3X9R7 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf148G3X9R7 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf148G3X9R7 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf148G3X9R7 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf148G3X9R7 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf148G3X9R7 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf148G3X9R7 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf148G3X9R7 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf148G3X9R7 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf148G3X9R7 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf148G3X9R7 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
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