Protein–RNA interactions for Protein: G3UVU6

Gm20517, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 20, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20517G3UVU6 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gm20517G3UVU6 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gm20517G3UVU6 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gm20517G3UVU6 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gm20517G3UVU6 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gm20517G3UVU6 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm20517G3UVU6 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm20517G3UVU6 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm20517G3UVU6 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm20517G3UVU6 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm20517G3UVU6 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm20517G3UVU6 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm20517G3UVU6 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm20517G3UVU6 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm20517G3UVU6 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm20517G3UVU6 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm20517G3UVU6 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm20517G3UVU6 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm20517G3UVU6 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm20517G3UVU6 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm20517G3UVU6 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm20517G3UVU6 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm20517G3UVU6 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm20517G3UVU6 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm20517G3UVU6 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm20517G3UVU6 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm20517G3UVU6 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm20517G3UVU6 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm20517G3UVU6 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm20517G3UVU6 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm20517G3UVU6 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm20517G3UVU6 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm20517G3UVU6 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm20517G3UVU6 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm20517G3UVU6 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm20517G3UVU6 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm20517G3UVU6 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm20517G3UVU6 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm20517G3UVU6 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm20517G3UVU6 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20517G3UVU6 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20517G3UVU6 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20517G3UVU6 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20517G3UVU6 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20517G3UVU6 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20517G3UVU6 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20517G3UVU6 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20517G3UVU6 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20517G3UVU6 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20517G3UVU6 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20517G3UVU6 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20517G3UVU6 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20517G3UVU6 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20517G3UVU6 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20517G3UVU6 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20517G3UVU6 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20517G3UVU6 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20517G3UVU6 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20517G3UVU6 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20517G3UVU6 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20517G3UVU6 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20517G3UVU6 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20517G3UVU6 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20517G3UVU6 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20517G3UVU6 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20517G3UVU6 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20517G3UVU6 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20517G3UVU6 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20517G3UVU6 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20517G3UVU6 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20517G3UVU6 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20517G3UVU6 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20517G3UVU6 Tceal8-204ENSMUST00000163584 2358 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20517G3UVU6 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20517G3UVU6 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20517G3UVU6 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20517G3UVU6 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20517G3UVU6 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20517G3UVU6 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20517G3UVU6 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20517G3UVU6 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20517G3UVU6 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20517G3UVU6 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20517G3UVU6 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20517G3UVU6 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20517G3UVU6 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20517G3UVU6 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20517G3UVU6 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20517G3UVU6 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20517G3UVU6 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20517G3UVU6 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20517G3UVU6 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm20517G3UVU6 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm20517G3UVU6 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm20517G3UVU6 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm20517G3UVU6 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm20517G3UVU6 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm20517G3UVU6 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm20517G3UVU6 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm20517G3UVU6 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms